Epigeneze je chemický jev, který spočívá v přeměně chemické povahy jednoho prvku na jiný bez změny jeho formy. Často se s ním setkáváme v procesu fosilizace .
Toto slovo utvořil francouzský mineralog Haüy z kořene slova epigen (épi [mimo] a gen).
Organismy mohou během posmrtné evoluce podstoupit mineralogickou náhradu nazvanou epigeneze .
Můžeme pozorovat například transformaci kalcitu na dolomit , poté na oxid křemičitý . Křemičité minerály jsou také nahrazeny kalcitem.