RNA-dependentní RNA polymeráza
RNA-dependentní RNA polymeráza
Virus RNA replikázy v Kongo-krymské horečce ( PDB 3PHU )
| Č. ES | ES |
|---|---|
| Číslo CAS |
| IUBMB | Vstup IUBMB |
|---|---|
| IntEnz | IntEnz pohled |
| BRENDA | Vstup BRENDA |
| KEGG | KEGG vstup |
| MetaCyc | Metabolická cesta |
| PRIAM | Profil |
| PDB | Struktury |
| JÍT | AmiGO / EGO |
RNA-dependentní RNA polymerázu ( RdRp , RDR ), někdy nazývaný RNA replikázy , je nucleotidyltransferase který katalyzuje na reakci :
nukleosid trifosfát + RNA č PPi + RNA n + 1.
Tento enzym katalyzuje replikaci RNA , na rozdíl od typické RNA polymerázy, která katalyzuje biosyntézu řetězce RNA z templátu DNA . Proto katalyzuje syntézu komplementárního řetězce RNA z řetězce RNA sloužícího jako templát. To je zásadní pro replikaci z RNA virů s negativní a pozitivní polaritou bez kroku DNA, to znamená, že ve skupinách III až V z klasifikace Baltimore :
- dvouvláknová RNA viry ( skupina III ), jako je například Cystoviridae (en) , Reoviridae , Hypoviridae , Partitiviridae , Totiviridae (en) , nebo dokonce i Birnaviridae rodiny ;
- kladná polarita single - pletl RNA viry ( skupina IV ), jako je například Nidovirales (včetně koronavirus ), Picornavirales nebo Tymovirales rodin ( fr ) ;
- virus negativní řetězec jednořetězcový RNA ( skupina V ) a Genome nesegmentované - Mononegavirales - nebo segmentované: arenavirus , Bunyaviral , Hantavirus , Nairovirus , Phlebovirus , Tenuivirus , Tospoviry a ortomyxovirem - včetně chřipky A , na virus chřipky typu B , je virus chřipky C a chřipka a druhy Thogotovirus a virus Isavirus (infekční anémie z lososa).
Iniciace reakce probíhá v blízkosti ‚konci templátu RNA řetězce 3. Může to být de novo priming (bez primeru) nebo použití genomového virového proteinu použitého jako primeru. De novo priming spočívá v přidání nukleosid trifosfátu do 3'- OH prvního priming nukleosid trifosfátu; tato reakce se následně opakuje během fáze prodlužování s dalšími nukleotid trifosfáty, aby se vytvořil řetězec RNA, který je komplementární k řetězci modelu RNA.
Poznámky a odkazy
- (in) Masato Akutsu, Yu Ye, Satpal Virdee, Jason W. Chin a David Komander , „ Molekulární základ pro zkříženou reaktivitu ubikvitinu a ISG15 ve virových doménách nádoru vaječníků “ , Sborník Národní akademie věd Spojených států Amerika , sv. 108, n O 6, 8. února 2011, str. 2228-2233 ( PMID 21266548 , PMCID 3038727 , DOI 10.1073 / pnas.1015287108 , číst online )
- (en) EV Koonin, AE Gorbalenya a KM Chumakova , „ Předběžná identifikace RNA-závislých RNA polymeráz dsRNA virů a jejich vztah k pozitivním řetězcům RNA virových polymeráz “ , FEBS Letters , sv. 252, č . 1-2, Červenec 1989, str. 42-46 ( PMID 2759231 , DOI 10.1016 / 0014-5793 (89) 80886-5 , číst online )
- (in) PM Zanotto, J. Gibbs, Gould EA a EC Holmes , „ Přehodnocení vyšší taxonomie virů je založeno na RNA polymerázách “ , Journal of Virology , sv. 70, n o 9, Září 1996, str. 6083-6096 ( PMID 8709232 , PMCID 190630 , číst online )
- (in) C.Cheng Kao, Paul Singh a David J. Ecker , „ De Novo Initiation of Viral RNA-Dependent RNA Synthesis “ , Virology , sv. 287, n O 2 Září 2001, str. 251-260 ( PMID 11531403 , DOI 10.1006 / viro.2001.1039 , číst online )