N-konec (nebo koncový amin , N-konec , N-konec nebo ukončení NH 2 ) se vztahují ke konci proteinu nebo polypeptidu, končící s aminokyselinou s funkčním aminem zdarma (-NH 2 ). Konvence zápisu pro peptidové sekvence umístí aminový konec nalevo, sekvence se poté zapíše od N konce ke karboxylovému konci . Když je protein přeložen z messengerové RNA , je vytvořen z N-konce na C-konec.
Každá aminokyselina má karboxylovou skupinu a aminoskupinu a aminokyseliny se mohou během dehydratační reakce vázat dohromady a vytvořit řetězec vytvořením vazby aminoskupiny kyselinového aminu ke karboxylové skupině následujících. Polypeptidové řetězce proto mají zakončení nenavázanou karboxylovou skupinou, C-koncem , a zakončení aminovou skupinou, N-koncem.
Když je protein přeložen z messengerové RNA, je vytvořen z N-konce na C Aminový konec aminokyseliny (na nabité přenosové RNA ) se během prodlužovací fáze translace váže na karboxylový konec rodícího se nebo rostoucího řetězce. Iniciační kodon na genetického kódu kódování methionin , většina proteinové sekvence začíná methioninem (a konkrétněji N -formylmethionine (fMet) pro bakterie). Některé proteiny jsou však modifikovány posttranslačním procesem , například během segmentace proteinovým prekurzorem , a mohou mít pro své zakončení různé aminokyseliny.
N-konec je první část proteinu, který opouští ribozom během syntézy proteinu . Někdy obsahuje sekvence, které fungují jako směrovací signál (druh intracelulárního poštovního směrovacího čísla), což umožňuje proteinu dosáhnout zamýšleného umístění v buňce. Signál cílení je obvykle potlačen po podání peptidázou . Amino-koncová N kyselina proteinu je navíc důležitým faktorem, který ovlivňuje jeho poločas (pravděpodobnost degradace). Tomu se říká pravidlo N-end .
Signální peptidSignální peptid na N-konci je rozpoznán částkou pro rozpoznávání signálu (SRP) a vede k zacílení proteinu na sekreční dráhu . V eukaryotických buňkách jsou tyto proteiny syntetizovány na úrovni endoplazmatického retikula . V prokaryotických buňkách jsou proteiny vylučovány buněčnou stěnou . V chloroplastech cílí signální peptidy proteiny na tylakoidy .
Mitochondriální cílený peptidMitochondriální peptid zaměřený na N-konec (mtTP) umožňuje zavedení proteinu do mitochondrií .
Cílení na chloroplastový peptidN-konec cílící na chloroplastový peptid (cpTP) umožňuje zavedení proteinu do chloroplastů .
Některé proteiny jsou po translaci modifikovány přidáním membránových markerů, které umožňují proteinu asociovat s membránou bez transmembránové domény . N-konec (jako C-konec) proteinu lze tímto způsobem změnit.
N-myristoylaceN-konec lze upravit přidáním myristoylové značky . Takto modifikované proteiny vykazují konsensuální motiv na svém N-konci sloužícím jako modifikační signál.
N-acylaceN-konec lze upravit přidáním značky mastné kyseliny z N-acylovaného proteinu. Nejběžnější formou této modifikace je přidání palmitoylové skupiny .