DNA nekódující někdy mylně nazvaný nevyžádané DNA nebo satelitní DNA ( nevyžádané DNA v angličtině, termín razil výzkumníkem Susumu Ohno 1972), se vztahuje na všechny sekvence v genomu , které nejsou převedeny do proteinů. Velkou část většiny eukaryotických genomů tvoří tato třída DNA, jejíž biologické funkce jsou špatně pochopeny a která byla částečně podceňována.
Nekódující DNA lze rozdělit do různých kategorií. Určité nekódující oblasti hrají roli v regulaci transkripce a zpracování RNA nebo v organizaci a údržbě genomu. Některé sekvence jsou přepsány do RNA, ale nejsou přeloženy do proteinů , a právě RNA má v buňce funkční roli. Některé nekódující oblasti sestávají z opakovaných sekvencí, které mohou být odvozeny z mobilních prvků DNA, které se v buňce replikují autonomně. Nakonec některé sekvence pravděpodobně nemají žádnou roli.
Podíl těchto různých kategorií DNA se u jednotlivých druhů liší a podíl „nefunkční“ DNA v genomech je stále předmětem debaty.
Většina rozdílů v restrikčních místech souvisí se změnami nekódujících sekvencí, které nemají žádný vliv na genovou expresi nebo fenotyp . Tyto restrikční mapy jsou nezávislé na genové exprese.
Genomy obsahují různé typy nekódující DNA:
Projekt ENCODE („Encyklopedie prvků DNA“) zahájený v roce 2003 Národním ústavem pro výzkum lidského genomu se zaměřil na studium funkcí lidských genů.
V roce 2007, po 4 letech práce na identifikaci a klasifikaci funkčních prvků 1% lidského genomu (3 000 000 000 párů bází ), autoři programu Encode dospěli k závěru, že DNA má složitější funkce než toto. miliarda párů bází lidské DNA, pokud pouze 1,5% skutečně přímo kóduje syntézu bílkovin ( exome ), zbytek (3,25 miliardy párů bází) byl kdysi považován za zbytečnou „nevyžádanou DNA“ nebo za pozůstatky minulých inkluzí nebo duplicitních chyb, které generují multiplicitu počtu kopií genů se nakonec jeví jako funkční. V roce 2012 byly tyto výsledky upřesněny: 80% lidského genomu by bylo funkčních v souvislosti se „specifickou biochemickou aktivitou“.
Vize, že 80% lidského genomu je „funkční“, je však velmi zpochybňována určitými biology, zejména evolučními specialisty , kteří poukazují zejména na velmi redukční představu „biochemické aktivity“ používanou členy konsorcia ENCODE.
Jejich hlavní argument je založen na skutečnosti, že podíl lidského genomu, který je pod selekčním tlakem, je menší než 10%, což je neslučitelné s tvrzením, že 80% našeho genomu má „funkci“.
Zatímco většina vědců odhaduje množství nekódující DNA na více než 80%, studie z roku 2008 připisuje ještě větší podíl nekódující DNA v lidském genomu, a to na 98%.
Tato práce pomůže porozumět principům organizujícím funkční prvky genomu, lépe porozumět transkripci DNA, určitým chorobám a vývoji zvířat. Mnoho z těchto sekvencí DNA je regulačních; řeknou kódujícím genům, kdy a kde mají být aktivní. Jejich nedostatek nebo genetické mutace v regulačních oblastech mohou být spojeny s genetickými chorobami.
Vědci také našli sekvence, které vypadají „neutrálně“, aktivně kopírovány, ale zjevně nemají pro organismus žádné důsledky a jejichž užitečnost není pochopena.
Ve světle těchto nálezů bude možná nutné znovu přezkoumat dopady „náhodné“ transgeneze na genom.