Hoogsteenovo párování (nebo dvojice Hoogsteenovo či odpovídající Hoogsteenovo ) je druh kanonické párování zahrnují puriny, pozorované v nukleové kyselině . Vodíkové vazby v Hoogsteenových párech zahrnují stranu purinu odlišnou od strany Watson-Crick a zejména polohy N7 a oxo nebo aminoskupinu v poloze 6. Existují dva typy Hoogsteenových párování, v závislosti na orientaci pyrimidinu vzhledem k purinu:
Tyto dvě konformace se liší o 180 stupňů rotací pyrimidinu.
Spárujte AU Hoogsteen přímo
Spárujte AU Hoogsteen vzad
Vzhledem k tomu, že párování Hoogsteen používá stranu purinu, která je nezávislá na straně Watson-Crick, je možné, aby purin prováděl oba typy interakcí současně. To umožňuje vytvářet struktury se třemi prameny, z nichž dva tvoří kanonickou šroubovici. Třetí řetězec se uvízne v hlavní drážce této šroubovice a vytvoří páry Hoogsteen s řetězcem DNA nebo RNA obsahujícím puriny. Tato struktura se může tvořit pouze v oblastech, kde duplex obsahuje sekvenci několika po sobě následujících purinů.
G kvadruplexy nebo G tetrady jsou čtyřvláknové struktury obsahující guanosiny . Interakce mezi čtyřmi vlákny probíhají párováním typu Hoogsteen mezi čtyřmi G umístěnými ve stejné rovině. Tato struktura je stabilizována přítomností jednomocného kationtu ve středu tetrady.
Hoogsteenovy páry často přispívají k tvorbě terciárních interakcí ve struktuře RNA . Nacházejí se zejména ve struktuře přenosové RNA , kde dva univerzálně konzervované nukleotidy, ribothymidin v poloze 54 a adenosin v poloze 58, tvoří Hoogsteenův pár, který se podílí na stabilizaci struktury této RNA.
Existenci těchto nekanonických párů navrhl v roce 1963 Karst Hoogsteen, který jim dal své jméno. Poprvé byly experimentálně pozorovány v krystalové struktuře přenosové RNA v roce 1974.