Ensembl je bioinformatický automatický systém anotací genomu . Jedná se o společný projekt Evropského bioinformatického institutu (EBI) a Wellcome Trust Sanger Institute, jehož ústřední myšlenkou je organizovat rozsáhlá pole biologických informací kolem genomových sekvencí .
Pro každý analyzovaný genom se Ensembl pokouší identifikovat automatickým procesem všechny geny, které obsahuje. K tomu se spoléhá na data ze stávajících sekvencí ( RNA , proteiny ), které „zavěsí“ na genom, aby odvodil strukturu genů.
Na tuto první vrstvu poznámek, strukturu genů, přidá Ensembl další prvky, mezi něž patří:
Ensembl se nejprve představuje jako „genom prohlížeče“ ( „ Genome Browser “ ), který zkoumá a vizualizuje různé úrovně genomů mnoha organismů.
Ensembl je také otevřená databáze, ze které lze volně čerpat, a to buď přímo, nebo prostřednictvím programovacího rozhraní nebo pomocí dotazovacího systému BioMart.
A konečně, Ensembl je otevřená softwarová infrastruktura, která umožňuje stavět různé systémy organizující data související s genomickými sekvencemi.
Projekt Ensembl je poháněn kulturou rozsáhlé otevřenosti, což znamená: