EcoRI

Eco RI (Eco "R" un) je restrikční enzym produkovaný bakteriálním kmenem Escherichia coli ,komenzální bakterií lidského trávicího systému . Jeho web pro rozpoznávání je následující:

5'-GAATTC-3' 3'-CTTAAG-5'

Většinou jsou restrikční místa palindromická , tj. Sekvence DNA je stejná, pokud se čte ze směru 5 'až 3'.

Jedná se o restrikční endonukleázu typu II, která je u bakterií velmi běžná.

EcoRI se pohybuje klouzáním po fosfátově-cukrovém řetězci DNA. EcoRI se může vázat na DNA dvěma způsoby: způsobem specifickým pro jeho rozpoznávací místo, nepohyblivým, vedoucím k štěpení DNA, a volnějším a nespecifickým způsobem umožňujícím jeho přemístění. Tyto 2 způsoby se používají střídavě a nepřetržitě.

Řez DNA bude na každém řetězci posunut o několik nukleotidů. Řez se říká, že generuje soudržné konce (na rozdíl od tupých konců, kde nedochází k posunu v řezu, získaného EcoRV, dalším restrikčním enzymem).

Poznámky a odkazy

1. (in) Donald C. Rau a Y. Nina Sidorova , „  Šíření restrikční nukleázy EcoRI podél DNA  “ , Journal of Molecular Biology , sv.  395, n O  2ledna 2010, str.  408-416 ( ISSN  0022-2836 , DOI  10.1016 / j.jmb.2009.10.049 , číst online , přístup k 3. listopadu 2018 )
2. B Polisky , P Greene , DE Garfin a BJ McCarthy , „  Specifičnost rozpoznávání substrátu restrikční endonukleázou EcoRI.  ”, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America , vol.  72, n o  9,Září 1975, str.  3310–3314 ( ISSN  0027-8424 , PMID  242001 , číst online , přístup k 3. listopadu 2018 )