V biochemii , je ligáza je enzym , který katalyzuje spojení dvou molekul (v angličtině ligace ) novými kovalentními vazbami s současném hydrolýzou z ATP , nebo jiných podobných molekul. Vytváří fosfodiesterové vazby z hydroxylovaného 3 'konce na 5' konec fosforu.
Současný název ligázy enzymů často obsahovat slovo „ ligázy “ jako DNA ligázy z fága T4 použité pro fragmenty struktury DNA . Jiné běžné názvy používají slovo „ syntetáza “, protože tyto enzymy katalyzují syntézu nových molekul.
Dávejte však pozor, abyste nezaměňovali enzymy syntetázy s enzymy syntázy (oba jsou enzymy ze skupiny ligáz). Syntázy, na rozdíl od syntetáz, nepoužívají energii uvolněnou defosforylací nukleotid trifosfátů (jako je ATP , GTP , CTP , TTP a UTP ) ke katalýze její reakce. Ve skutečnosti syntáza vytváří a štěpí dvojné vazby proteinu ...
Ligázy jsou klasifikovány jako EC 6 v nomenklatuře enzymů ES . Tuto třídu lze poté rozdělit do šesti podtříd:
EC 6.1.1.1 tyrosin tRNA ligáza EC 6.1.1.2 tryptofan tRNA ligáza EC 6.1.1.3 threonin tRNA ligáza EC 6.1.1.4 leucin tRNA ligáza EC 6.1.1.5 isoleucin tRNA ligáza EC 6.1.1.6 lysin tRNA ligáza EC 6.1.1.7 alanin tRNA ligáza EC 6.1.1.8 vypuštěná EC 6.1.1.9 valinová tRNA ligáza EC 6.1.1.10 methioninová tRNA ligáza EC 6.1.1.11 serinová tRNA ligáza EC 6.1.1.12 aspartátová tRNA ligáza EC 6.1.1.13 D-alanin-poly (fosforibitol) ligáza EC 6.1.1.14 glycin TRNA ligáza EC 6.1.1.15 prolin tRNA ligáza EC 6.1.1.16 cystein tRNA ligáza EC 6.1.1.17 glutamát tRNA ligáza EC 6.1.1.18 glutamin tRNA ligáza EC 6.1.1.19 arginin tRNA ligáza EC 6.1.1.20 fenylalanin tRNA ligáza EC 6.1.1.21 histidinová tRNA ligáza EC 6.1.1.22 asparagin tRNA ligáza EC 6.1.1.23 aspartát tRNA Asn ligáza EC 6.1.1.24 glutamát tRNA Gln ligáza EC 6.1.1.25 vypuštěno EC 6.1.1.26 pyrrolysin tRNA Pyl ligáza EC 6.1.1.27 O- fosfosin tRNA ligáza
EC 6.2.1.1 acetát - CoA ligáza EC 6.2.1.2 butyrát - CoA ligáza EC 6.2.1.3 kyselina s dlouhým řetězcem - CoA ligáza EC 6.2.1.4 sukcinát - CoA ligáza (tvorba GDP) EC 6.2.1.5 sukcinát - CoA ligáza (ADP - tvorba) EC 6.2.1.6 glutarát - CoA ligáza EC 6.2.1.7 cholát - CoA ligáza EC 6.2.1.8 oxalát - CoA ligáza EC 6.2.1.9 malát - CoA ligáza EC 6.2.1.10 kyselina - CoA ligáza (tvorba GDP) EC 6.2. 1.11 biotin - CoA ligáza EC 6.2.1.12 4-kumarát - CoA ligáza EC 6.2.1.13 acetát - CoA ligáza (tvorba ADP) EC 6.2.1.14 6-karboxyhexanoát - CoA ligáza EC 6.2.1.15 arachidonát - CoA ligáza EC 6.2. 1.16 acetoacetát - CoA ligáza EC 6.2.1.17 propionát - CoA ligáza EC 6.2.1.18 citrát - CoA ligáza EC 6.2.1.19 kyselina s dlouhým řetězcem - luciferinová složka ligáza EC 6.2.1.20 kyselina s dlouhým řetězcem— [acyl- nosič-protein] ligáza EC 6.2 .1.21 nahrazeno EC 6.2.1.30 EC 6.2.1.22 [citrát ( pro -3 S ) -lyáza] ligáza EC 6.2.1.23 dikarboxylát - CoA ligáza EC 6.2.1.24 fytanát - CoA ligáza EC 6.2.1.25 benzoát - CoA EC 6.2. 1,26 o- sukcinylbenzoa ligáza te - CoA ligáza EC 6.2.1.27 4-hydroxybenzoát - CoA ligáza EC 6.2.1.28 3α, 7α-dihydroxy-5β-cholestanát - CoA ligáza EC 6.2.1.29 vypuštěno EC 6.2.1.30 fenylacetát - CoA ligáza EC 6.2.1.31 2-furoát —CoA ligáza EC 6.2.1.32 antranilát - CoA ligáza EC 6.2.1.33 4-chlorbenzoát - CoA ligáza EC 6.2.1.34 trans -feruloyl-CoA syntáza EC 6.2.1.35 ACP-SH: acetát ligáza EC 6.2.1.36 3-hydroxypropionyl-CoA syntáza EC 6.2.1.37 3-hydroxybenzoát - CoA ligáza EC 6.2.1.38 (2,2,3-trimethyl-5-oxocyklopent-3-enyl) acetyl-CoA syntáza EC 6.2.1.39 [butirosin acyl-nosičový protein] —L- glutamát ligáza EC 6.2.1.40 4-hydroxybutyrát - CoA ligáza
EC 6.3.1.1 aspartát - amoniak ligáza EC 6.3.1.2 glutamát - amoniak ligáza EC 6.3.1.3 nyní EC 6.3.4.13 EC 6.3.1.4 aspartát - amoniak ligáza (tvorba ADP) EC 6.3.1.5 NAD + syntáza EC 6.3.1.6 glutamát —Etylaminamináza EC 6.3.1.7 4-methylenglutamát - amoniak ligáza EC 6.3.1.8 glutathioneylspermidin syntáza EC 6.3.1.9 trypanothion syntáza EC 6.3.1.10 adenosylcobinamid-fosfát syntáza EC 6.3.1.11 glutamát - putrescin ligáza EC 6.3.1.12 D-aspartát ligáza) EC 6.3.1.13 L-cystein: 1D- myo- inositol 2-amino-2-deoxy-α-D-glukopyranosid ligáza EC 6.3.1.14 difthin-amoniak ligáza EC 6.3.1.15 syntáza 8-demethylnovobioové kyseliny EC 6.3.1.16 převedena na EC 6.3.3.6 EC 6.3.1.17 β-citrylglutamát syntáza
EC 6.3.2.1 pantoát - β-alanin ligáza EC 6.3.2.2 glutamát-cystein ligáza EC 6.3.2.3 glutathion syntáza EC 6.3.2.4 D-alanin - D-alanin ligáza EC 6.3.2.5 fosfopantothenát-cystein ligáza EC 6.3 .2,6 fosforibosylaminoimidazolessinkarboxamid EC 6.3.2.7 UDP- N -acetylmuramoyl-L-alanyl-D-glutamát - L-lysin ligáza EC 6.3.2.8 UDP- N- acetylmuramát - L-alanin ligáza EC 6.3.2.9 UDP- N- acetylmuramoylalanin - -glutamát ligáza EC 6.3.2.10 UDP- N -acetylmuramoylalanyl-tripeptid - D-alanyl-D-alanin ligáza EC 6.3.2.11 karnosin syntáza EC 6.3.2.12 dihydrofolát syntáza EC 6.3.2.13 UDP- N- acetylmuramoyl-L-alanyl-D -glutamát— 2,6-diaminopimelát ligáza EC 6.3.2.14 enterobaktin syntáza EC 6.3.2.15 vypuštěno kvůli EC 6.3.2.10 EC 6.3.2.16 D-alanin - alanyl-poly (glycerolfosfát) ligáza EC 6.3.2.17 tetrahydrofolát syntáza EC 6.3. 2,18 γ-glutamylhistamin syntáza EC 6.3.2.19 ubikvitin - protein ligáza EC 6.3.2.20 indoleacetát-lysin syntetáza EC 6.3.2.21 ubikvitin - kalmodulin ligáza EC 6.3.2.22 nyní EC 6.3.1.14 EC 6.3.2.23 homoglutathion syntáza EC 6.3.2.24 tyrosin-arginin ligáza EC 6.3.2.25 tubulin-tyrosin ligáza EC 6.3.2.26 N- (5-amino-5-karboxypentanoyl) -L- cysteinyl-D-valin syntetáza EC 6.3.2.27 nahrazena EC 6.3.2.38 a EC 6.3.2.39 EC 6.3.2.28 L-aminokyselina α-ligáza EC 6.3.2.29 cyanophycin syntáza (přidání L-aspartátu) EC 6.3.2.30 cyanofycin syntáza (L-arginin-přidávání) EC 6.3.2.31 koenzym F 420 -0: L-glutamátu ligáza EC 6.3.2.32 koenzym y-F 420 -2: α-L-glutamátu ligázy EC 6.3.2.33 tetrahydrosarcinapterin syntázy EC 6.3. 2,34 koenzym F 420 -1: γ-L-glutamátu ligáza EC 6.3.2.35 D-alanin - D-serinu ligázy EC 6.3.2.36 4-phosphopantoate - p-alaninu ligázy EC 6.3.2.37 UDP- N- acetylmuramoyl-L-alanyl -D-glutamát - D-lysin ligáza EC 6.3.2.38 N 2- citryl- N 6- acetyl- N 6- hydroxylysin syntáza EC 6.3.2.39 aerobactin syntáza EC 6.3.2.40 cyklopeptin syntáza EC 6.3.2.41 N - acetylaspartylglutamát syntáza EC 6.3 .2,42 N- acetylaspartylglutamylgluta mate syntáza
EC 6.3.3 Cyklo-ligázy (enzymy, které tvoří heterocyklické kruhy)
EC 6.3.3.1 fosforibosylformylglycinamidin cykloligáza EC 6.3.3.2 5-formyltetrahydrofolát cykloligáza EC 6.3.3.3 dethiobiotin syntáza EC 6.3.3.4 (karboxyethyl) arginin β-laktam-syntetáza EC 6.3.3.5 O- ureido-D-serin cyklo- ligáza EC 6.3.3.6 karbapenam-3-karboxylát syntáza
EC 6.3.4 jiné ligandy uhlík-dusík
EC 6.3.4.1 nahrazeno EC 6.3.5.2 EC 6.3.4.2 CTP syntáza (hydrolýza glutaminu) EC 6.3.4.3 mravenčan-tetrahydrofolát ligáza EC 6.3.4.4 adenylosukcinát syntáza EC 6.3.4.5 argininosukcinát syntáza EC 6.3.4.6 močovina karboxyláza EC 6.3.4.7 ribóza-5-fosfát - amoniak ligáza EC 6.3.4.8 imidazolacetát - fosforibosyldifosfát ligáza EC 6.3.4.9 biotin - [methylmalonyl-CoA-karboxytransferáza] ligáza EC 6.3.4.10 biotin - [propionyl-CoA-karboxyláza (ATP-hydrolyzující)] ligáza EC 6.3.4.11 biotin— [methylkrotonoyl-CoA-karboxyláza] ligáza EC 6.3.4.12 glutamát - methylamin ligáza EC 6.3.4.13 fosforibosylamin - glycin ligáza EC 6.3.4.14 biotin karboxyláza EC 6.3.4.15 biotin - [acetyl-CoA-karboxyláza] ligáza EC 6.3.4.16 karbamoylfosfát syntáza (amoniak) EC 6.3.4.17 mravenčan-dihydrofolát ligáza EC 6.3.4.18 5- (karboxyamino) imidazol ribonukleotid syntáza EC 6.3.4.19 tRNA Ile- lysidinsyntetáza EC 6.3.4.20 7-kyano-7-deazaguanin syntetáza EC 6.3.4.21 nikotinát fosforibosyltransferáza EC 6 .3.4.22 tRNA Ile2 -agmatinylcytidine syntáza EC 6.3.4.23 mravenčí-phosphoribosylaminoimidazolecarboxamide ligáza
EC 6.3.5 Ligázy uhlík-dusík s glutaminem jako amido-N-dárcem.
EC 6.3.5.1 NAD + syntáza (glutamin-hydrolýza) EC 6.3.5.2 GMP syntáza (glutamin-hydrolýza) EC 6.3.5.3 fosforibosylformylglycinamidin syntáza EC 6.3.5.4 asparagin syntáza (glutamin-hydrolýza) EC 6.3.5.5 karbamoyl-fosfát syntáza (glutamin) -hydrolýza) EC 6.3.5.6 asparaginyl-tRNA syntáza (glutamin-hydrolýza) EC 6.3.5.7 glutaminyl-tRNA syntáza (glutamin-hydrolýza) EC 6.3.5.8 nyní EC 2.6.1.85 EC 6.3.5.9 kyselina hydrogenobyrinová a, c- diamid syntáza (hydrolýza glutaminu) EC 6.3.5.10 syntáza kyseliny adenosylkobyrové (glutamin-hydrolýza) EC 6.3.5.11 kobyrinát a , c- diamid syntáza
EC 6.4.1.1 pyruvátkarboxyláza EC 6.4.1.2 acetyl-CoA karboxyláza EC 6.4.1.3 propionyl-CoA karboxyláza EC 6.4.1.4 methylkrotonoyl-CoA karboxyláza EC 6.4.1.5 geranoyl-CoA karboxyláza EC 6.4.1.6 acetonkarboxyláza EC 6.4.1.7 2- oxoglutarátkarboxyláza EC 6.4.1.8 acetofenonkarboxyláza
EC 6.5.1.1 DNA ligáza (ATP) EC 6.5.1.2 DNA ligáza (NAD + ) EC 6.5.1.3 RNA ligáza (ATP) EC 6.5.1.4 RNA 3'-terminální fosfát cykláza (ATP) EC 6.5.1.5 RNA 3 ' -terminální fosfátcykláza (GTP)
EC 6.6.1.1 hořečnatá chelatáza EC 6.6.1.2 kobaltochelatáza