Tumor Identity Cards ( CIT ) je program zahájený v roce 2000 a financovaný Národní ligou proti rakovině , jehož cílem je charakterizovat více typů nádorů prostřednictvím genomové analýzy genové exprese spojené s těmito chromozomálními změnami pomocí vysoce propustnost biotechnologií / biočipů .
Tento personalizovaný léčebný program by měl nakonec umožnit každému pacientovi:
Informace týkající se pacientů jsou anonymizovány a poznámky týkající se klinického monitorování, stejně jako výsledky různých biologických a genetických testů prováděných na pacientech, jsou zahrnuty do databáze se zabezpečeným přístupem (Annotator). Kontroluje se úplnost a konzistence informací. Tyto klinicko-biologické anotace jsou poté překódovány podle mezinárodních a interních standardů. Analýzy lze tedy provádět na několika projektech se zajištěním srovnatelnosti anotací.
Kvalita biologických zdrojů představuje hlavní prvek v reprodukovatelnosti získaných výsledků. Program CIT vytvořil platformu věnovanou extrakci a kvalifikaci RNA a DNA s ověřenými a standardizovanými protokoly, která umožňuje optimalizovat výkon platformy, implementovat kontroly kvality jemnějších a zlepšit výkon ještě dalších hybridizací o částečné degradaci vzorků nádoru.
Program CIT si vybral komerční technologie k provedení hybridizace na biočipech , zejména „ Affymetrix GeneChip Arrays“ pro studium genové exprese, „ Illumina BeadArrays“ pro studium alotypů, SNP a methylom a sekvenování příští generace pro exomy a miRNA. . Jedním z klíčových bodů programu CIT je zpracování co největšího počtu vzorků na stejné technologické platformě se stejnými protokoly.
Data se poté analyzují v programu za použití standardních metod z literatury nebo inovativních vnitřním vývoji prováděných s volným softwarem statistické R . Studie provedené CIT umožnily publikaci 90 článků v mezinárodních časopisech.
Program, který je postaven na sítích vědců , patologů , lékařů a bioinformatiků , zahrnuje 60 partnerských týmů a nabízí jednu z největších databází nádorů v Evropě, založenou na standardizovaném procesu a obsahující více než 10 000 anotovaných vzorků nádorů a 14 000 experimentů s biočipy .
Genomické studie se také provádějí na myších modelech pro určité typy rakoviny.