Ribozomální RNA ( rRNA ), je hlavní složkou ribosomu , ke kterému se dává jméno. Ačkoli někdy nesprávně nazývaný ribozomální RNA anglicismem ( ribozomální RNA v angličtině), francouzský název této molekuly je ribozomální RNA .
Různé rRNA jsou páteří i srdcem ribozomu , komplex ribonukleoproteinů (složený z proteinů a RNA ) používaný k překladu genetické informace kódované na messenger RNA (mRNA). To pochází z transkripce části genomu , ze které syntetizuje proteiny v buňce . Kromě rRNA je ribozom tvořen přibližně padesáti proteiny zvanými ribozomální proteiny .
Ribozomální RNA se samy produkují z genů kódovaných v DNA . Jsou transkribována ve formě delších prekurzorů, které se potom štěpí za vzniku různých rRNA. U eukaryot dochází k tomuto procesu zrání / štěpení v nukleolu . Z ribozomů umístěných v cytosolu se rRNA skládají do sebe a vytvářejí kompaktní trojrozměrnou strukturu . Tato struktura chrání rRNA, které jsou velmi stabilní, na rozdíl od messengerových RNA, které mají obecně krátkou životnost.
U eukaryot transkribuje RNA polymeráza I prekurzor RNA 5.8S, 18S a 28S (prekurzor 45S), které potom vyzrávají a procházejí různými chemickými modifikacemi.
Poté je štěpen snoRNP (malý nukleosomální RiboNucleoProtein nebo „malý nukleosomální ribonukleoprotein“), což jsou ribonukleoproteinové komplexy (komplexy tvořené ribonukleovou kyselinou a proteiny).
Jako většina RNA je ribozomální RNA kódována geny. Existuje mnoho kopií v genomu (200) umístěných v jádře na 5 akrocentrických chromozomech . Geny kódující RNA jsou uspořádány v párech a stejně jako u prokaryotů jsou odděleny nepřepisovanými mezerami, oblastmi DNA, které nekódují.
28S rRNA , rRNA 5.8S a 18S rRNA jsou syntetizovány v jadérka , zatímco 5S rRNA se syntetizuje mimo jadérka v nucleoplasm , ale stále v jádře .
Jednotka S je Svedbergův symbol, který odpovídá sedimentační konstantě.
RNA malé podjednotky se podílí na čtení messengerové RNA. Je to on, kdo kontroluje, že interakce mezi kodonem nacházející se v místě A ribozomu a antikodonu na tRNA je správná. RNA malé podjednotky je tedy kontrolorem věrnosti translace genetické zprávy na protein .
Velká RNA velké podjednotky ribozomu se podílí na tvorbě peptidových vazeb . Je to on, kdo je přímým katalyzátorem biosyntézy bílkovin . Aktivní centrum ribozomu, nazývané peptidyltransferáza , je tvořeno výhradně z ribozomální RNA. Krystalografická struktura ribozomu ukázala, že v 50 až 60 Á od tohoto aktivního místa nebyl žádný protein . RRNA velké podjednotky je proto ribozym .
Bakteriální ribozomální RNA ( prokaryoty ) jsou terčem téměř poloviny antibiotik používaných v humánní nebo veterinární terapii. Tato antibiotika, většinou odvozená z přírodních produktů, fungují buď blokováním překladu, nebo tím, že způsobují chyby ribozomu.
Hlavní skupiny antibiotik působících na rRNA:
Ribosomová malá podjednotka RNA je molekula, jejíž sekvence je široce používána pro fylogenetické studie využívající nástroje bioinformatiky. Nachází se konzervovaný ve všech živých organismech. Porovnáním genových sekvencí této RNA u různých druhů je možné posoudit jejich evoluční příbuznost. Databáze „Projekt ribosomální databáze“ rdp.cme.msu.edu uvádí seznam 16S nebo 18S ribosomálních RNA sekvencí od více než 270 000 žijících druhů. Tyto údaje umožňují rekonstruovat fylogenetický strom druhu.