Fluorescenční marker v PCR

Mnoho fluorescenčních markerů se používá v PCR ( polymerázová řetězová reakce ).

Historický

Z důvodu srozumitelnosti data odpovídají první publikaci v oboru a jsou uváděni pouze první autoři, úplné odkazy jsou v kapitole „bibliografie“.

• 1880  : První syntetické kultivační médium pro fluorescenční mikroorganismy Hueppe F.
• 1964  : Detekce fluorescence DNA spojené s BET od Lepecq JB.
• 1972  : První migrace DNA na elektroforetickém gelu Aaij C.
• 1986  : První veřejná publikace o PCR od Kary Mullis (Nobelova cena za chemii v roce 1993).
• 1989  : První detekce produktu PCR pomocí BET (a nikoli radioaktivitou) pomocí Xu ZD.
• 1992  : Vynález PCR v reálném čase Higuchi R.
• 1994  : Patentování SYBR Green I pomocí molekulárních sond.
• 1995  : První použití SYBR greenu k detekci produktu PCR od Schneebergera C.
• 1995  : Vynález hydrolýzních sond Livak KJ.

Nespecifické značky

DNA interkaláty

Značky drobných drážek

Asymetrické kyanidriny

Specifické značky sekvence

Hybridizační sondy

Hydrolýzní sondy

Sonda je konstruována s použitím donoru ( fluorescein , jehož excitační vlnová délka je 530 nm) a "quencheur", naroubovaného na polynukleotid komplementární k požadované sekvenci DNA.

Sondy molekulárních majáků

Scorpions sondy

Bibliografie

Francouzská bibliografie

• Hueppe F. Studie o modrém mléce. Cohn's Beiträge zur Biologie der Pflanzen. 1880; 3

• Lepecq JB, Yot P, Paoletti C. Interakce mezi ethidium hydrobromidem (BET) a nukleovými kyselinami (AN). Spektrofluorometrická studie. [Interakce ethidiumbromhydrátu (BET) s nukleovými kyselinami (NA). Spektrofluorimetrická studie.] CR Hebd Seances Acad Sci. 1964; 259: 1786-9.

• Poitras E, Houde A. Real-time PCR: principy a aplikace. Recenze v oboru biologie a biotechnologie (Kanada). 2002; 2 (2): 2-11

• Tsé C, Capeau J. Kvantifikace nukleových kyselin kvantitativní real-time PCR. Ann Biol Clin (Paříž). 2003; 61 (3): 279–93

Anglická bibliografie

• Aaij C, Borst P. Gelová elektroforéza DNA. 1972. Biochim Biophys Acta. 10. května; 269 (2): 192-200.

• Higuchi R, Dollinger G, Walsh PS, Griffith R. Simultánní amplifikace a detekce specifických sekvencí DNA. 1992. Biotechnology; 10: 413–7.

• Livak KJ, Flood JA, Marmaro J, Giusti W, Deetz K. Oligonukleotidy s fluorescenčními barvivy na opačných koncích poskytují systém kalené sondy užitečný pro detekci produktu PCR a hybridizace nukleových kyselin. 1995. PCR Method Appl. 4: 357-362.

• Mullis K, Faloona F, Scharf S, Saiki R, Horn G, Erlich H. Specifická enzymatická amplifikace DNA in vitro: polymerázová řetězová reakce. Cold Spring Harb Symp Quant Biol. 1986; 51 Pt 1: 263-73.

• Schneeberger C, Speiser P, Kury F, Zeillinger R. Kvantitativní detekce produktů reverzní transkriptázy-PCR pomocí nového a citlivého barvení DNA. 1995. PCR Methods Appl. Únor; 4 (4): 234-8.

• Xu ZD, Yu YJ, Hsie AW, Caskey CT, Rossiter B, Gibbs RA. Screening delece na místě hypoxantin-guanin fosforibosyltransferázy v buňkách čínských křečků pomocí polymerázové řetězové reakce. 1989. Teratog Carcinog Mutagen; 9 (3): 177-87.