důvod Kelch
důvod Kelch
Struktura galaktózooxidázy
(en) z
Hypomyces rosellus (
PDB 1GOF )
Důvod Kelch 2
Vzor Kelch 3 (centrální oblast galaktózooxidázy
(in) )
Vzor Kelch 4 (centrální oblast galaktózooxidázy
(in) )
Důvod Kelch 5
Důvod Kelch 6
Kelch motiv , z německého Kelch znamená „ kalich “, i které Kelch , je strukturální motiv široce distribuován v proteinech z druhů od bakterií do eukaryot . To odpovídá sekvenci asi padesáti zbytků z aminokyselin tvořících „čepel“ v listu p čtyřmi prameny. Nacházejí se od pěti do osmi kopií na protein, které se skládají dohromady a tvoří velkou plochu v β-vrtule solenoidového typu .
Kelchův motiv je široce přítomen v bakteriích a eukaryotech. Lidský genom obsahuje asi sto proteiny, které vykazují Kelch vzor . Tento vzorec se objevuje několikrát na molekulu proteinu. Je zjištěno, například, v miPP proteinu (en) u myší, v několika Poxviridae , v a a p scruins v galaktózooxidázy (en) z Dactylium dendroides , stejně tak jako v YjhT proteinu Escherichia coli , enzym katalyzující na mutarotace z kyseliny sialové .
V případě galaktózoxidázy odpovídá opakování Kelchových jednotek β listu se čtyřmi antiparalelními řetězci tvořícími β-vrtuli .
Poznámky a odkazy
-
(en) Nobutoshi Ito, Simon EV Phillips, Conrad Stevens, Zumrut B. Ogel, Michael J. McPherson, Jeffery N. Keen, Kapil DS Yadav a Peter F. Knowles , „ Nové thioetherové vazby odhalené 1,7 Å krystalová struktura galaktózooxidázy “ , Nature , sv. 350, n O 6313,
7. března 1991, str. 87-90 ( PMID 2002850 , DOI 10.1038 / 350087a0 , Bibcode 1991 Natat.350 ... 87I , číst online )
-
(in) Josephine Adams, Reed Kelso a Lynn Cooley , „ Kelchova opakovaná nadrodina proteinů: vrtule buněčné funkce “ , Trends in Cell Biology , sv. 10, n o 1,
ledna 2000, str. 17-24 ( PMID 10603472 , DOI 10.1016 / S0962-8924 (99) 01673-6 , číst online )
-
(in) Feiyu Xue a Lynn Cooley , „ Kelch kódoval složku mezibuněčných můstků ve vaječných komorách Drosophila “ , Cell , sv. 72, n o 5,
12. března 1993, str. 681-693 ( PMID 8453663 , DOI 10.1016 / 0092-8674 (93) 90397-9 , číst online )
-
(in) Peer Bork , „ Drosophila kelch pattern je odvozen od společného enzymového záhybu “ , Journal of Molecular Biology , sv. 236, n o 5,
11. března 1994, str. 1277-1282 ( PMID 8126718 , DOI 10,1016 / 0022-2836 (94) 90056-6 , číst on-line )
-
(in) Mr. Way, Mr. Sanders, Mr. Chafel, YH Tu, A. Knight and P. Matsudaira , „ beta-Scruin, protějšek aktinu zesíťujícího proteinového scruinu, je lokalizován do akrozomálního váčku spermatu Limulus ” , Journal of Cell Science , roč. 108, n o 10,
Říjen 1995, str. 3155-3162 ( PMID 7593276 , číst online )
-
(in) Mr. Way, Mr. Sanders, C. Garcia, J. Sakai and P. Matsudaira , „ Sequence and domain organization of scruin, year-actin crosslinking protein in the process of Limulus sperm acrosomal “ , The Journal of Cell Biology , sv. 128, n kost 1-2,
Leden 1995, str. 51-60 ( PMID 7822422 , PMCID 2120335 , DOI 10.1083 / jcb.128.1.51 , číst online )
-
(in) Emmanuele Severi, Axel Müller, Jennifer R. Potts, Andrew Leech, David Williamson, Keith S.Wilson a Gavin H. Thomas , „ Mutarotace kyseliny sialové je katalyzována β-vrtulovým proteinem Escherichia coli β-vrtulovým proteinem YjhT “ , Journal of Biologická chemie , sv. 283, n o 8,
22. února 2008, str. 4841-4849 ( PMID 18063573 , DOI 10.1074 / jbc.M707822200 , číst online )
-
(en) Nobutoshi Ito, Simon EV Phillips, Kapil DS Yadav a Peter F. Knowles , „ Krystalová struktura enzymu volných radikálů, galaktózaoxidáza “ , Journal of Molecular Biology , sv. 238, n o 5,
20. května 1994, str. 794-814 ( PMID 8182749 , DOI 10.1006 / jmbi.1994.1335 , číst online )
Struktura galaktózooxidázy (en) z Hypomyces rosellus ( PDB 1GOF )