Polyketid syntáza
Polyketidů syntáza je polyfunkční enzym nebo enzymový komplex, produkující polyketidů , velká rodina sekundárních metabolitů v bakterií , hub , rostlin a některých linií zvířat . Biosyntéza polyketidů show nápadných podobností s biosyntézy mastných kyselin provádí mastné kyseliny syntázy . The genů kódujících polyketidové synthasy jsou uspořádány do operonu v bakteriích a do genových klastrů v eukaryot .
Existují tři typy polyketidových syntáz:
- typ I , skládající se z velkých multifunkčních enzymů,
- typ II , skládající se z komplexů menších enzymů, z nichž každý je monofunkční,
- typu III , sestávající z polyketidových syntáz, které nepoužívají doménu PCR .
Polyketidové řetězce během montáže jsou připojeny k polyketidové syntáze thioesterovou vazbou na thiolové skupině . Tato vazba se na konci syntézy rozbije hydrolýzou nebo cyklizací (alkoholýzou nebo aminolýzou). Mechanismus prodloužení řetězu by byl následující:
- Primer, obecně acetyl-CoA a malonyl-CoA , je vložen s acyltransferázou na PCR domény primeru jednotky, a potom se převede do cysteinový zbytek o o ketosynthase domény .
- Prodlužovací jednotka, typicky malonyl-CoA nebo methylmalonyl-CoA , je naplněna acyltransferázou na doménu ACP. Enzymový komplex poté katalyzuje Claisenovu kondenzaci primeru na elongační jednotce: ketosyntáza je uvolněna a doména ACP je nyní spojena se samotnou elongační jednotkou kondenzovanou na primeru. Tato sada se poté přenese do ketosyntázy a uvolní doménu ACP.
- Prodlužovací jednotka je nanesena na doménu PCR a dále dochází ke Claisenově kondenzaci s polyketidovým řetězcem spojeným s ketosyntázou. Vytvořený produkt navázaný na PCR se přenese do ketosyntázy a cyklus začíná znovu.
- Na řetězci, který se prodlužuje v každém kroku působením jiných enzymů, mohou nastat modifikace za účelem zavedení například hydroxylových skupin nebo dvojných vazeb .
- A thioesterasu zasahuje na konci syntézy, aby se uvolnil polyketid řetězce spojenou s doménou AKT polyketidového syntázy.
Poznámky a odkazy
-
(in) Chaitan Khosla, Rajesh S. Gokhale, John R. Jacobsen a David E. Cane , „ TOLERANCE A SPECIFIKACE polyketidových SYNTASES “ , Annual Review of Biochemistry , sv. 68,
Červenec 1999, str. 219-253 ( číst online ) DOI : 10.1146 / annurev.biochem.68.1.219 PMID 10872449
-
(in) Holger Jenke-Kodama, Axel Sandmann, Rolf Müller a Elke Dittmann , „ Evoluční důsledky bakteriálních polyketidových syntáz “ , Molecular Biology and Evolution , sv. 22, n o 10,
Října 2005, str. 2027-2039 ( číst online ) DOI : 10,1093 / molbev / msi193 PMID 15958783