RNA polymeráza II

RNA polymerázy II ( RNAP II nebo Pol II ) je nucleotidyltransferase přítomen v buňkách z eukaryot . Je to jedna z RNA polymeráz těchto organismů spolu s RNA polymerázou I , RNA polymerázou III a RNA polymerázou IV . Ona realizuje transkripci z DNA za vzniku pre-messenger RNA a většina malých jaderných RNA a mikroRNA . Jedná se o proteinový komplex 550  kDa, který vyžaduje velké množství transkripčních faktorů, aby se mohl vázat na promotor a zahájit transkripci.

RNA polymeráza II se skládá z 10 až 12 podjednotek (12 v kvasinkách a u lidí ), mezi nimiž byly identifikovány různé interakce:

• DNA-dependentní RPB1 RNA polymerázy II - podjednotku Kódovaná u lidí podle POLR2A genu a, v kvasinkách, které RPO21 genem . Jedná se o největší podjednotku RNA polymerázy II. Obsahuje doménu C -terminální skupinu obsahující až 52 opakování vzoru sedmi  zbytků z aminokyselinové Tyr - Ser - Pro - Thr - Ser - Pro - Ser nezbytné pro aktivitu polymerázy . Tvoří spolu s dalšími podjednotkami doménu, která se váže na DNA, ve formě štěrbiny, ve které je templát DNA přepsán do RNA. Silně interaguje s podjednotkou PRB8.

• PRB2 podjednotku - Jedná se o druhou největší podjednotku enzymu. S alespoň dvěma dalšími podjednotkami tvoří strukturu, která udržuje kontakt v aktivním místě enzymu, templátu DNA a nově syntetizované RNA.

• PRB3 podjednotku - Jedná se o třetí největší podjednotku enzymu. Existuje jako heterodimer s jinou polymerázovou podjednotkou, tvořící podsestavu s řetězcem POLR2J. Silně interaguje s podjednotkami RPB1-5, 7 a 10-12.

• Podjednotka RPB4 (gen POLR2D ) - Měla by mít ochrannou roli proti stresu.

• Podjednotka RPB5 (gen POLR2E ) - Každá RNA polymerázy II v úvahu duplikátu. Silně interaguje s podjednotkami RPB1, 3 a 6.

• RPB6 podjednotka - spolu s alespoň dvěma dalšími podjednotkami, tvoří strukturu, která stabilizuje polymerázy na DNA templátu v průběhu transkripce.

• Podjednotku RPB7 (gen POLR2G ) - Mohlo by hrát regulační roli. Silně interaguje s podjednotkami RPB1 a 5.

• Podjednotka RPB8 (gen POLR2H ) - Je interaguje s podjednotek RPB1-3, 5 a 7.

• RPB9 podjednotka ( POLR2I gen ) - spolu s RPB1 podjednotkou, že představuje štěrbinu, ve které DNA templát podá během transkripce.

• Podjednotka RPB10 (gen POLR2L ) - Je interaguje s podjednotek RPB1-3 a 5, a v ostrém RPB3.

• RPB11 podjednotka - to je samo o sobě skládá ze tří podjednotek u lidí: POLR2J (RPB11-a), POLR2J2 (RPB11-b) a POLR2J3 (RPB11-c)

• Podjednotka RPB12 (gen POLR2K ) - To také interaguje s podjednotkou RPB3.

Poznámky a odkazy

1. (in) Peter A. Meyer, Ping Ye, Zhang Mincheng, Man-Hee Suh a Fucorrespondenceemail Jianhua , „  Fázování RNA polymerázy II pomocí intrinsicky vázaných atomů Zn: aktualizovaný strukturální model  “ , Structure , sv.  14, n O  6, červen 2006, str.  973-982 ( PMID  16765890 , DOI  10,1016 / j.str.2006.04.003 , číst on-line )
2. (in) Roger D. Kornberg , „  Eukaryotická transkripční kontrola  “ , Trends in Cell Biology , sv.  9, n o  12, Prosince 1999, M46-M49 ( PMID  10611681 , DOI  10.1016 / S0962-8924 (99) 01679-7 , číst online )
3. (in) Robert J. Sims III Subhrangsu S. Mandal a Danny Reinberg , „  Nedávné poznatky o transkripci zprostředkované RNA polymerázou II  “ , Current Opinion in Cell Biology , sv.  16, n o  3, Červen 2004, str.  263-271 ( PMID  15145350 , DOI  10.1016 / j.ceb.2004.04.004 , číst online )
4. (in) Vic E. Myer a Richard A. Young , „  RNA Polymerase II and holoenzymes subcomplexes  “ , Journal of Biological Chemistry , sv.  273, n o  43, 23. října 1998, str.  27757-27760 ( PMID  9774381 , DOI  10.1074 / jbc.273.43.27757 , číst online )
5. (en) Joël Acker, Michael de Graaff, Isabelle Cheynel, Vladimir Khazak, Claude Kedinger a Marc Vigneron , „  Interaction between the Human RNA Polymerase II Subunits  “ , Journal of Biological Chemistry , sv.  272, n o  27, 4. července 1997, str.  16815-16821 ( PMID  9201987 , DOI  10.1074 / jbc.272.27.16815 , číst online )
6. (in) WJ Brickey a AL Greenleaf , „  Funkční studie karboxy-terminální repetiční domény Drosophila RNA Polymerase II in Vivo  “ , Genetics , sv.  140, n O  2 Červen 1995, str.  599-613 ( PMID  7498740 , PMCID  1206638 , číst online )