CpG dinukleotid , někdy nazývaný CpG místo s odkazy na anglický stránkách CpG , je segment DNA ze dvou nukleotidů , jejichž sekvence z nukleobáze je C G . Zápis "CpG" je zkratka pro cytosin - fosfát - guanin, kterou je třeba jasně odlišit od zápisu "CG", který může také určit pár bází na dvou odlišných řetězcích DNA, a nikoli sekvenci řetězce DNA, darovanou DNA. V genomech mají dinukleotidy CpG jinou distribuci než jiné dinukleotidy jako GpC, ApT nebo TpA, protože definují ostrůvky CpG, ve kterých je jejich koncentrace mnohem vyšší a které hrají roli v regulaci exprese .
K cytosinové zbytky z CpG dinukleotidy lze methyluje na 5-methylcytosin . U savců může methylace cytosinu genu tento inaktivovat jako součást obecnějšího mechanismu vztahujícího se k epigenetice ; jsou enzymy , které provádějí na methylace DNA jsou DNA methyltransferáz . Od 70% do 80% cytosinových zbytků CpG dinukleotidů je methylováno u savců.
Nemetylované CpG dinukleotidy mohou být detekovány receptory podobnými Toll TLR9 v plazmatických dendritických buňkách , monocytech , NK buňkách a B buňkách u lidí . To umožňuje detekovat intracelulární přítomnost DNA infekčních agens, jako jsou viry , houby nebo bakterie .
Již dlouho bylo zjištěno, že výskyt CpG dinukleotidy v genomu z obratlovců , je podstatně nižší, než by se dalo očekávat, že statisticky najít. Takže v genomu, který má rychlost GC 42%, je pravděpodobnost sekvence CG na daném řetězci DNA (0,42 / 2) 2 = 0,0441 = 4,41% , pro srovnání frekvence CpG dinukleotidu v lidském genomu , což je pouze 1%. Vysvětlení tohoto statistického anomálie bylo navrženo v roce 1967 na spontánní deaminace z 5-methylcytosinu na thyminu za působení cytosinu methylace všech CpG dinukleotidů, které mají sklon se postupně převést jej do TPG dinukleotidů.