FtsK

FtsK ( F ilamenting t emperature- s ensitive mutantní K ) je translokáza a protein divisome z Escherichia coli .

Role

Vyskytuje se na konci replikace DNA a je lokalizován na úrovni septa interakcí s FtsZ prostřednictvím N-koncových domén proteinů umístěných v membráně. In vivo umožňuje FtsK rozlišení dimeru chromozomu, který se může vytvořit během replikace DNA (opravnými jevy zvanými crossovery ). Jeho rolí je pak pumpovat DNA, aby našla 2 různá místa (jedno na chromozom), kde proběhne poslední homologní rekombinační událost ; to je místně specifická rekombinace, která zahrnuje přítomnost tyrosinu rekombinázy XerC a XerD upevněn na dif místech . Když jsou tyto seřízeny v přepážce pomocí FtsK, interakce mezi FtsK a XerD aktivuje rekombinaci, je vyměněn řetězec DNA a dva chromozomy mohou být poté odděleny a odděleny v každé ze dvou dceřiných buněk.

Popis

Primární strukturu FtsK (1329 aminokyselin) lze rozdělit do tří částí:

• N-terminální doména, ukotvená v membráně 4 transmembránovými šroubovicemi a interagující s určitými dalšími proteiny divisomu, aby byla zajištěna jejich lokalizace;
• „ linkerová  “ doména  , velmi dlouhá (přibližně 600 aminokyselin), bohatá na proliny a glutaminy , jejichž funkce dosud není známa;
• C-koncová doména, která má vlastnost „ hexamerování  “ s jinými C-koncovými doménami, čímž vytváří kruh kolem DNA. Tato doména je motorickou doménou proteinu, který spotřebovává ATP a který umožňuje pumpovat DNA rychlostí přibližně 5 000 bp / s. Klasifikuje tedy FtsK do rodiny AAA + ATPáz . Tuto doménu lze rozdělit na tři subdomény α, β a γ:
  • α a β tvoří samotný motor, který má místo vázání a hydrolýzy ATP. Předpokládá se, že subdoména α využívá po hydrolýze ATP, což by umožnilo „translokovat“ DNA.
  • Subdoména γ má aktivitu regulující aktivitu motoru. Je skutečně schopen interakce s krátkými sekvencemi DNA, které jsou orientovány podél chromozomu tak, aby ukazovaly na různá místa . Dále jen „hexamerization“ kolem těchto sekvencí umožňuje orientaci translokace z FtsK vůči dif místech . Když je jich dosaženo, je to opět interakce mezi subdoménami y a XerD, která umožní aktivaci místně specifické rekombinace.

Související články

• FtsZ

Poznámky a odkazy

1. (in) FtsK is a DNA Motor Protein that Activates Chromosome Dimer Resolution Switching by the State of Catalytic XerC and XerD Recombinases , Aussel et al ., Cell (108), 2002
2. ATPázy spojené s různými buněčnými aktivitami
3. (v) dvouřetězcové DNA translokace: Struktura a mechanismu hexamerní FtsK Massey a spol ., Molecular Cell (23), 2006
4. Tyto sekvence DNA, dlouhé 8 bp, byly kvůli své roli přezdívány KOPS : polární sekvence orientované na FtsK
5. (in) Molekulární mechanismus sekvenčně řízeného nakládání a translokace DNA pomocí FtsK , Lowe et al , Molecular Cell (31), 2008