Národní centrum pro biotechnologické informace

Národní centrum pro biotechnologické informace Logo NCBI evokuje dvojitou šroubovici DNA . Obrázek v Infoboxu. Dějiny
Nadace 4. listopadu 1988
Rám
Akronym (en)  NCBI
Typ Výzkumný ústav , biologická databáze , datová knihovna
Sedadlo Bethesda
Země  Spojené státy
Kontaktní informace 38 ° 59 ′ 45 ″ severní šířky, 77 ° 05 ′ 56 ″ západní délky
Organizace
Mateřská organizace United States National Library of Medicine
webová stránka (en)  www.ncbi.nlm.nih.gov

National Center for Biotechnology Information ( NCBI ), ve francouzštině "  American Center for Biotechnology Information  ", je americký Národní institut pro molekulární biologické informace .

Tato organizace, která byla založena v roce 1988 a sídlí v Bethesdě v Marylandu , je součástí americké lékařské knihovny , jednoho z amerických zdravotnických institutů .

Mise

NCBI provádí výzkum v oblasti výpočetní biologie, vyvíjí software pro analýzu dat genomu a poskytování biomedicínských informací.

NCBI není databáze, ale vyvíjí také veřejné databáze, jako například:

Je to svým způsobem americký protějšek Evropského institutu pro bioinformatiku (EBI).

NCBI nabízí a obsahuje databázi taxonomie NCBI, která je pouze orientační. Webové stránky NCBI upřesňují, že tato databáze není spolehlivým zdrojem pro nomenklaturu nebo klasifikaci a nejspolehlivější informace je třeba vyhledat v příslušné vědecké literatuře. Taxonomie NCBI představuje asi 10% živých druhů na planetě. Tato taxonomie je kurátorskou klasifikací a je navržena jako organizovaná nomenklatura pro sekvence organismů ve veřejných databázích. TaxID (jedinečný identifikátor v taxonomii NCBI) slouží jako spojovací článek mezi třemi databázemi International Nucleotide Sequence Database Collaboration (INSDC, dále jen „International Collaboration in Nucleotide Sequence Database “), jejichž členem je DNA Data Bank of Japan. ( DDBJ), NCBI (USA) a Evropský institut pro bioinformatiku (EMBL-EBI, Evropa).

Poznámky a odkazy

  1. (in) „  Zřeknutí se odpovědnosti: Databáze taxonomie NCBI není autoritativním zdrojem pro nomenklaturu nebo klasifikaci - nejspolehlivější informace najdete v příslušné vědecké literatuře.  » (Viz zápatí na tomto příkladu výzkumu .)
  2. „  Home - Taxonomy - NCBI  “ , na www.ncbi.nlm.nih.gov (přístup k 30. srpnu 2017 )
  3. (in) Scott Federhen Karen Clark , Tanya Barrett a Helen Parkinson , „  Směrem k bohatším metadatům pro mikrobiální sekvence: Nahrazení taxonomie taxonomie NCBI na úrovni kmene Bioprojectem, BioSample records and Assembly  “ , Standards in Genomic Sciences , sv.  9, n o  3,15. června 2014, str.  1275 ( ISSN  1944-3277 , DOI  10.4056 / sigs.4851102 , číst online , přístup k 30. srpnu 2017 )
  4. (in) „  Mezinárodní spolupráce s databází nukleotidových sekvencí | INSDC  ” , na www.insdc.org (přístup k 30. srpnu 2017 )

Podívejte se také

Související články

  • Enter , NCBI Global Cross-Database Search System.
  • BLAST , software NCBI, umožňující srovnání nukleotidových a proteinových sekvencí.
  • Seznam stránek Wikipedie popisujících taxony pomocí odkazu NCBI .

externí odkazy