Virus Nipah

Virus Nipah Popis tohoto obrázku, také komentován níže Barevný obrázek částice viru Nipah získaný transmisní elektronovou mikroskopií v červenci 2018. Klasifikace
Typ Virus
Pole Riboviria
Větev Negarnaviricota
Dílčí embr. Haploviricotina
Třída Monjiviricetes
Objednat Mononegavirales
Rodina Paramyxoviridae
Druh Henipavirus

Druh

Henipavirus Nipah
ICTV

Fylogenetická klasifikace

Pozice:

Viru Nipah je infekční činidlo , které v lidech , způsobuje infekce virem Nipah , je vážným respirační a neurologické onemocnění s fatálními následky v rozmezí od 40% do 75% v závislosti na epidemií . Je to jedno - pletl RNA virus z záporné polarity (skupina V této klasifikace Baltimore ) a ze s unsegmented genomu , které patří do rodiny z Paramyxoviridae , rodu Henipavirus . Jeho přirozeným rezervoárem je kaloň ovocný , zejména druhy přítomné v Oceánii , jihovýchodní Asii , jižní Asii a subsaharské Africe .

Viru Nipah Genom se skládá z 18,2  kb kódující šest strukturálních proteinů . Jak je u paramyxovirů pravidlem , počet nukleotidů v tomto genomu je násobkem šesti, což se nazývá „  pravidlo šesti  “. Odchylka od tohoto pravidla, mutací nebo tvorbou neúplného genomu, činí množení viru neúčinným, pravděpodobně kvůli strukturálním omezením v důsledku interakce mezi RNA a nukleoproteinem N viru.

Viru Nipah je obklopen virového obalu zhotoveného z lipidové dvojvrstvy překrývající matricové proteiny označené M . Povrch viru představuje G glykoproteiny zajišťující adhezi ( připojení v angličtině) viru na hostitelské buňce , zejména na efrinu B2 , vysoce konzervovaném proteinu přítomném u mnoha savců , a trimery F proteinů zajišťující fúzi viru membrána s plazmatickou membránou hostitelské buňky, přičemž vedlejším účinkem je tvorba velké syncytie, která je výsledkem fúze několika sousedních hostitelských buněk pod účinkem tohoto virového proteinu; trojrozměrná struktura připevňovacího G proteinu byla stanovena rentgenovou krystalografií . Vnitřek viru se skládá z RNA viru a proteinu N z nukleokapsidový komplexu s proteinem L působí jako enzym typu RNA-dependentní RNA polymerasa sama spojena s fosfoprotein P nezbytný pro enzymatickou aktivitu proteinu L.

Stejně jako ostatní Henipavirus , viru Nipah vyrábí několik různých proteinů z jediného genu P, v důsledku procesu úpravou na messenger RNA , v tomto případě pomocí posttranskripční modifikace , zahrnující přidání jedné nebo dvou zbytků z guanosinu v genu Úprava místa P před transkripcí pomocí ribozomy z buňky hostitele  : genu P a P produkuje protein z nemodifikované RNA, protein v v případě vložení zbytku guanosin, a W protein v případě vložení dvou zbytků guanosinu; čtvrtý přepis, protein C , je výsledkem alternativního otevřeného čtecího rámce . Pokud fosfoprotein P přispívá k aktivitě RNA polymerázy závislé na RNA proteinu L, hrají proteiny V, W a C roli inhibitoru antivirové obrany hostitelské buňky, aniž by byl pochopen přesný mechanismus jejich mechanismu účinku .

Vzhledem k biologickému nebezpečí, které představuje, lze s virem Nipah manipulovat pouze v laboratoři P4 nebo BSL-4 .

Virus Nipah způsobil v roce 1998 v Malajsii epidemii , přičemž mezihostiteli byla prasata, což mělo za následek porážku mnoha stád.

Poznámky a odkazy

  1. (in) Image zveřejněny na Flickr podle NIAID (červenec 2018).
  2. (in) „  Virus Taxonomy: Release 2018b  “ , ICTV , července 2018(zpřístupněno 4. července 2019 ) .
  4. (in) Lin-Fa Wang, Brian H. Harcourt, Meng Yu, Azaibi Tamin, Paul A. Rota, William J. Bellini a Bryan Eaton , „  Molekulární biologie virů Hendra a Nipah  “ , Mikroby a infekce , let.  3, n o  4, Duben 2001, str.  279-287 ( PMID  11334745 , DOI  10.1016 / S1286-4579 (01) 01381-8 , číst online )
  5. (in) Daniel Kolakofsky Thierry Pelet, Dominique Garcin Stéphane Hausmann, Joseph Curran a Laurent Roux , „  syntéza paramyxovirové RNA a požadavek na délku genomu hexameru: pravidlo šesti revizí  “ , Journal of Virology , sv.  72, n O  2 Února 1998, str.  891-899 ( PMID  9444980 , PMCID  124.558 , číst on-line )
  6. (in) YP Chan, Chua KB, CL Koh, ME Lim a SK Lam , „  Kompletní nukleotidové sekvence izolátů z malajského viru Nipah  “ , The Journal of General Virology , sv.  82, n o  Pt 9, Září 2001, str.  2151-2155 ( PMID  11514724 , DOI  10.1099 / 0022-1317-82-9-2151 , číst online )
  7. (in) Kim Halpin, Bettina Bankamp, ​​Brian H. Harcourt, William J. Bellini a Paul A. Rota , „  Nipah odpovídá pravidlu šesti v testu replikace minigenomu  “ , The Journal of General Virology , sv.  85, n o  Pt 3, Březen 2003, str.  701-707 ( PMID  14993656 , DOI  10.1099 / vir.0.19685-0 , číst online )
  8. (in) Filip Yabukarski, Philip Lawrence, Nicolas Tarbouriech Jean-Marie Bourhis, Elise Delaforge, Malene Ringkjøbing Jensen, Rob WH Ruigrok Martin Blackledge Viktor Volchkov a Marc Jamin , „  Struktura Nipah nesestaveného nukleoproteinu v komplexu s virovým chaperonem  “ , Nature Strukturální a molekulární biologie , sv.  21, n o  9, září 2014, str.  754-759 ( PMID  25108352 , DOI  10.1038 / nsmb.2868 , číst online )
  10. (in) Oscar A. Negrete, Ernest L. Levroney Hector C. Aguilar, Andrea Bertolotti-Ciarlet Ronen Nazarian a Sara Tajyar Benhur Lee , „  EphrinB2 je vstupní receptor pro virus Nipah, vznikající smrtící paramyxovirus  “ , Nature , sv.  436, n O  7049, 21. července 2005, str.  401-405 ( PMID  16007075 , DOI  10.1038 / nature03838 , Bibcode  2005 Natur.436..401N , číst online )
  11. (in) Thomas A. Bowden, Max Crispin E. Yvonne Jones a David I. Stuart , „  Sdílená architektura paramyxovirového glykoproteinu je adaptovaná pro různé strategie připevnění  “ , Biochemical Society Transaction , sv.  38, n o  5, 24. září 2010, str.  1349-1355 ( PMID  20863312 , PMCID  3433257 , DOI  10.1042 / BST0381349 , číst online )
  12. (in) KB Chua, WJ Bellini, PA Rota, BH Harcourt A. Tamin, SK Lam, Ksiazek TG, PE Rollin, SR Zaki W.-J. Shieh, CS Goldsmith, DJ Gubler, JT Roehrig, B. Eaton, AR Gould, J. Olson, H. Field, P. Daniels, AE Ling, CJ Peters, LJ Anderson2 a BWJ Mahy , „  Nipah Virus: A Recently Emergent Deadly Paramyxovirus  “ , Science , sv.  288, n O  5470, 26. května 2000, str.  1432-1435 ( PMID  10827955 , DOI  10.1126 / science.288.5470.1432 , JSTOR  3075321 , Bibcode  2000Sci ... 288.1432C , číst online )
  13. (in) Thomas A. Bowden, Max Crispin, David J. Harvey, A. Radu Aricescu Jonathan Grimes, E. Yvonne Jones a David I. Stuart , „  Krystalová struktura a analýza sacharidů u přílohy Nipah Virus Glykoprotein: šablona pro antivirotika and Vaccine Design  ” , Journal of Virology , sv.  82, n o  23, prosince 2008, str.  11628-11636 ( PMID  18815311 , PMCID  2583688 , DOI  10.1128 / JVI.01344-08 , číst online )
  16. (in) „  Biologická bezpečnost v mikrobiologických a biomedicínských laboratořích, 5. vydání  “ , CDC , prosince 2009(zpřístupněno 5. července 2019 ) .
  17. (in) Oddíl VIII - Souhrnná prohlášení agentů , CDC , 2009.
  18. , volný přístup.
  19. „ Prokleté jezero“, autor: Chong Fah Hing , Revue Jentayu , zvláštní vydání „V těchto nejistých dobách“, červenec 2020 ( ISBN  979-10-96165-19-3 ) .