Xanthomonas oryzae pv oryzae

Xanthomonas oryzae
pathovar oryzae Popis tohoto obrázku, také komentován níže Příznaky bakteriálního onemocnění způsobeného Xanthomonas oryzae pv oryzae na rýži. Klasifikace
Panování Bakterie
Větev Proteobakterie
Třída Gammaproteobakterie
Objednat Xanthomonadales
Rodina Xanthomonadaceae
Druh Xanthomonas
Druh Xanthomonas oryzae

Pathovar

Xanthomonas oryzae pathovar oryzae
(ex ? Ishiyama 1922 ) Swings et al. , 1990

Xanthomonas oryzae pv oryzae je jedním ze dvou pathovars připojených k Xanthomonas oryzae , druhy z Proteobacteria , patřící do čeledi z Xanthomonadaceae .

Tato bakterie, jejíž hlavním hostitelem je rýže ( Oryza sativa ), je zodpovědná za jedno z nejzávažnějších onemocnění rýže , které se  v jihovýchodní Asii nazývá bakteriální onemocnění rýže (nebo rýžová bakteriální plíseň ), nebo „  kresek “. Je přítomen ve většině regionů pěstování rýže na světě, s výjimkou Středomoří .

Za příznivých podmínek pro toto onemocnění mohou ztráty výnosu dosáhnout 70%.

Genom této bakterie (MAFF kmen 311018) byl sekvenován v roce 2005 napsal japonský tým . Tento genom, složený z jediného kruhového chromozomu , má velikost 4 940 217  bp . Jeho struktura je charakterizována velkým počtem efektorových genů (avr). Tato bakterie je považována za modelový organismus pro analýzu interakce rostlin a patogenů, protože je známo více než 30 různých ras podle jejich virulence a že v rýži bylo identifikováno 25 genů rezistence (jejichž genom byl také identifikován. Sekvence).

Synonyma

Rozsah hostitelů

Kromě pěstované rýže Xanthomonas campestris pathovar oryzae připouští jako hostitelské rostliny různé druhy Poaceae (Grasses) a Cyperaceae (Carex).

Z Poaceae najdeme zejména: Cenchrus ciliaris (Rhodesian cenchrus), Cynodon dactylon (quackgrass), Echinochloa crus-galli (kohoutková tráva), Leersia hexandra , Leersia japonica , Leersia oryzoides (leersia pravá), Leersia sayanuin , Leptochloa sayanuka , Leptochloa panicea , Oryza sp. (druhy rodu Oryza , zejména Oryza rufipogon a Oryza australiensis v Austrálii), Panicum maximum (tráva Guinea), Paspalum scrobiculatum (tráva meče), Urochloa mutica (tráva Para), Zizania aquatica (divoká rýže), Zizania palustris (divoká rýže) a Zoysia japonica (japonská zoysie);

a mezi Cyperaceae  : Cyperus difformis (malokvětý nutgrass), Cyperus rotundus (nutgrass).

Leersia sayanuka je nejdůležitějším hostitelem v Japonsku, protože tento druh zajišťuje přežití bakterií během zimy a běžně se vyskytuje v oblastech, kde je tato choroba endemická.

Poznámky a odkazy

  1. Roskov Y., Ower G., Orrell T., Nicolson D., Bailly N. Kirk PM, Bourgoin T., DeWalt RE, Decock W., van Nieukerken EJ, Penev L. (eds.) (2020). Species 2000 & ITIS Catalog of Life , 2020-12-01. Digitální zdroj na www.catalogueoflife.org . Druh 2000: Naturalis, Leiden, Nizozemsko. ISSN 2405-8858, přístup 26. října 2014
  2. „  Informační list o karanténních škůdcích - Xanthomonas oryzae  “ , EPPO (přístup k 25. říjnu 2014 ) .
  3. (in) Hirokazu Ochiai, Yasuhiro Inoue, Masaru Takeya, Aeni Sasaki a Hisatoshi Kaku, „  Genome Sequence of Xanthomonas oryzae pv. oryzae navrhuje příspěvek velkého počtu efektorových genů a sekvencí inzerce k jeho rasové rozmanitosti  “ , Japan Agricultural Research Quarterly (JARQ) , sv.  39, n O  4, 2005), str.  275–287 ( číst online ).
  4. (in) „  bakteriální listová plíseň rýže - Xanthomonas oryzae pv. oryzae (např. Ishiyama 1922) Swings et al. 1990  “ , na Invasive.org (přístup k 25. říjnu 2014 ) .
  5. (in) „  Xanthomonas oryzae pv. oryzae  ” na Cooperative Agricultural Pest Survey (CAPS) (přístup k 26. říjnu 2014 ) .
  6. (in) „  Hodnocení rizika: Xanthomonas oryzae pv. oryzae, bakteriální listová plíseň nebo kresekova choroba  “ , NCSU / APHIS Plant Pest Forecast (NAPPFAST) (přístup 26. října 2014 ) .
  7. (in) Shu Huang Or, Rice Diseases , CAB International / IRRI ,1985, 380  s. ( ISBN  978-0-85198-545-9 , číst online ) , s.  79.

externí odkazy