Panování | Bakterie |
---|---|
Větev | Proteobakterie |
Třída | Gammaproteobakterie |
Objednat | Xanthomonadales |
Rodina | Xanthomonadaceae |
Druh | Xanthomonas |
Druh | Xanthomonas oryzae |
Xanthomonas oryzae pv oryzae je jedním ze dvou pathovars připojených k Xanthomonas oryzae , druhy z Proteobacteria , patřící do čeledi z Xanthomonadaceae .
Tato bakterie, jejíž hlavním hostitelem je rýže ( Oryza sativa ), je zodpovědná za jedno z nejzávažnějších onemocnění rýže , které se v jihovýchodní Asii nazývá bakteriální onemocnění rýže (nebo rýžová bakteriální plíseň ), nebo „ kresek “. Je přítomen ve většině regionů pěstování rýže na světě, s výjimkou Středomoří .
Za příznivých podmínek pro toto onemocnění mohou ztráty výnosu dosáhnout 70%.
Genom této bakterie (MAFF kmen 311018) byl sekvenován v roce 2005 napsal japonský tým . Tento genom, složený z jediného kruhového chromozomu , má velikost 4 940 217 bp . Jeho struktura je charakterizována velkým počtem efektorových genů (avr). Tato bakterie je považována za modelový organismus pro analýzu interakce rostlin a patogenů, protože je známo více než 30 různých ras podle jejich virulence a že v rýži bylo identifikováno 25 genů rezistence (jejichž genom byl také identifikován. Sekvence).
Kromě pěstované rýže Xanthomonas campestris pathovar oryzae připouští jako hostitelské rostliny různé druhy Poaceae (Grasses) a Cyperaceae (Carex).
Z Poaceae najdeme zejména: Cenchrus ciliaris (Rhodesian cenchrus), Cynodon dactylon (quackgrass), Echinochloa crus-galli (kohoutková tráva), Leersia hexandra , Leersia japonica , Leersia oryzoides (leersia pravá), Leersia sayanuin , Leptochloa sayanuka , Leptochloa panicea , Oryza sp. (druhy rodu Oryza , zejména Oryza rufipogon a Oryza australiensis v Austrálii), Panicum maximum (tráva Guinea), Paspalum scrobiculatum (tráva meče), Urochloa mutica (tráva Para), Zizania aquatica (divoká rýže), Zizania palustris (divoká rýže) a Zoysia japonica (japonská zoysie);
a mezi Cyperaceae : Cyperus difformis (malokvětý nutgrass), Cyperus rotundus (nutgrass).
Leersia sayanuka je nejdůležitějším hostitelem v Japonsku, protože tento druh zajišťuje přežití bakterií během zimy a běžně se vyskytuje v oblastech, kde je tato choroba endemická.