Eubacteria ( Bakterie nebo Eubacteria ), nebo „ bakterie opravdové “, jsou hlavní skupinou prokaryot . Podle teorie tří domén tvoří eubakterie jednu ze tří hlavních subtypů, které rozdělují živý svět, další dvě jsou archaea (další skupina prokaryot ) a eukaryoty . Pro ostatní odborníky na systematiku jsou eubakterie mnohem starší než ostatní dvě domény, takže by nepředstavovaly monofyletickou skupinu, ale parafyletickou známku .
Patří mezi ně například sinice (které podle symbiogeneze pocházejí z chloroplastů ), proteobakterie ( podle stejné teorie odvozené mitochondrie ), mykoplazma ( mollicutes ), Enterobacteriaceae , pseudomonády a většina bakterií v grampozitivní formě .
K vytvoření taxonu Eubacteria , považovaného za primární království , došlo v roce 1977.
Přejmenování v doméně Bacteria , provedené v roce 1990, není přijato všemi biology.
Eubakterie se na jedné straně od eukaryot odlišují buněčnou strukturou (prokaryotickou strukturou), jejíž jednou z charakteristik je, že je bez jader, a na druhé straně od archea různými chemickými aspekty (včetně struktury buněčné membrány) a genetika.
Jejich velikost se liší od velikosti viru, jako u některých nanobakterií (0,05 µm), až po velikost větší než u průměrných prvoků ( Epulopiscium fishelsoni (600 µm x 80 µm) je mnohem větší než Paramecium ).
Mnoho bakterií má extracelulární struktury, jako například:
Některé bakterie mohou vytvářet tenké vrstvy mimo buněčnou stěnu, obvykle tvořené převážně polysacharidy (cukry).
Bakterie skupiny Cytophaga - Flavobacterium produkují slizovitou vrstvu, která jim umožňuje zůstat v těsném kontaktu s pevným médiem. Jiné bakterie jako Spirillum se mohou obklopit proteinovou vrstvou zvanou S vrstva .
Některé bakterie jsou mobilní a mohou se pohybovat pomocí bičíků. Bičíky v bakteriích jsou dlouhé a flexibilní bílkovinné přílohy. Jejich počet a poloha se mohou lišit v závislosti na druhu. Monotrichova polární bičování (nebo ciliatura) odpovídá přítomnosti jediného bičíku na jednom pólu bakterie (příklad Vibrio ). Lophotricheova polární bičování odpovídá přítomnosti několika bičíků na pólu bakterie ( Pseudomonas ). Jiné bakterie, jako je Escherichia coli, produkují bičíky po celém buněčném povrchu, a proto mají peritrichózní bičování.
Mnoho bakterií (jako Escherichia coli ) má dva odlišné způsoby pohybu: pohyb vpřed (plavání) a rotační pohyb nebo „kolečkový“ pohyb, který se v angličtině nazývá také „lang“. Omílání jim umožňuje přeorientovat se a nutí je provádět trojrozměrný pohyb, který se vyvinul v náhodný pohyb chůze . Bičíky skupiny bakterií, spirochety, se nacházejí mezi dvěma membránami v periplazmatickém prostoru.
Vlákno bičíku je tvořeno proteinem, bičíkem . Typ rotace bičíku může určit typ pohybu bakterií.
Mobilní bakterie mohou reagovat na podněty, mohou být přitahovány k živinám, jako jsou cukry, aminokyseliny, kyslík, nebo mohou být odpuzovány škodlivými látkami. Jedná se o chemotaxi , fototaxi a magnetotaxi . Toto chování se nazývá chemotaxe . Chemoreceptory proteinové povahy jsou přítomny na úrovni plazmatické membrány a periplazmy bakterií a mohou detekovat různé atraktivní nebo škodlivé látky.
Měděné ionty blokují rotaci bičíků. Aby to začalo znovu, uchýlili jsme se k kyselině ethylendiamintetraoctové , schopné zachytit ionty a tím uvolnit bičík.
Tradiční klasifikace rozlišuje na základě metabolismu fotosyntetizující bakterie a chemotrofní bakterie .
Gramovo barvení je určujícím faktorem pro taxonomie (vektor klasifikace) Bakteriální. Umožňuje diskriminaci mezi grampozitivními a gramnegativními eubakteriemi .
Moderní systematika, založená na genetických analýzách, rozlišuje mnoho skupin. Jeden si všimne mimo jiné sinic , důležité skupiny fotosyntetických bakterií.
Podle Thomase Cavalier-Smitha tvoří parafyletickou skupinu ( Neomura , ve které vznikají Archaea a Eukaryotes ), zatímco klasicky od Carla Woese tvoří pouze jednu ze tří domén života . Mikrobiologové upřednostňují Woeseovu klasifikaci na základě [[fylogenetika | fylogenetika ]]. Když byla objevena Archaea, jejich schopnost vyvíjet se v prostředích, která jsou pro život klasicky nepříznivá, naznačovala, že se Archaea objevila před bakteriemi, což odůvodňovalo název Archeobacteria (staré bakterie). Bakterie byly poté přejmenovány na Eubacteria (skutečné bakterie). Mezitím fylogenetické analýzy ukázaly, že Archaea jsou fylogeneticky blíže k eukaryotům než k bakteriím a že se objevily po bakteriích .
Model se třemi doménami , který navrhl Carl Woese , je převážně přijímaným paradigmatem .
Existují i další evoluční modely: podle alternativní teorie Thomase Cavaliera-Smitha se dvěma superkrálami nebo se dvěma říšemi , podle Gupty se dvěma doménami, stejně jako podle hypotézy Valase a Bourna v superkrálech (syntéza práce Lake et al. , Gupta a Cavalier-Smith).
Tyto modely jsou založeny na pojmu progresivní známka .
Historicky a možná stále v obecné mysli jsou bakterie spojovány s chorobami. Mnoho parazitů jsou skutečně bakterie (opak není pravdou). Studium bakterií dlouho dominovalo patologii a v menší míře i technickými aplikacemi (včetně fermentace , ať už na její podporu nebo v boji proti ní).
Eubakterie se vyskytují téměř v jakémkoli prostředí, kde je možný život. Jejich distribuce sahá od atmosféry po spodní hranice půdy a oceánského dna, včetně všech ekosystémů .
V závislosti na liniích najdeme fototrofy (odvozující jejich energii ze světla), chemotrofy (zjišťující jejich energii z neorganických chemických gradientů), heterotrofy (zjišťující jejich energii v organické hmotě, ať už živé ( parazitismus ) nebo mrtvé ( saprofytismus )); shledáváme aerobní nebo anaerobní , přísné nebo ne.