Historie Židů v Nikaragui nezačala až XX -tého století, komunity, zejména původu Ashkenazi zůstala velmi malá a většinou emigroval v pozdních 1970 pod tlakem režimu Sandinista. Od 90. let se někteří členové vrátili do Nikaraguy .
První přistěhovalci přijeli do Nikaraguy z východní Evropy po roce 1929, většina se usadila v hlavním městě Managua . Přes svůj malý počet se významně podíleli na hospodářském rozvoji země v odvětvích zemědělství, průmyslu a maloobchodu.
Komunita shromážděná v Congregacion Israelita de Nicaragua , měla synagogu , byly zřízeny pobočky B'nai B'rith a Ženské mezinárodní sionistické organizace (WIZO).
Židé byli v letech 1960–70 konfrontováni s antisemitismem pocházejícím z sandinistických kruhů, který potvrdil, že byli využíváni jako prostředníci Izraele k prodeji zbraní režimu diktátora Somozy . Když se chopila moci Sandinistická fronta národního osvobození, vzrostlo napětí mezi komunitou a socialisticky orientovaným režimem blízkým Organizaci pro osvobození Palestiny .
Navzdory své malé velikosti komunita zahrnovala dvě důležité politické osobnosti, členy sandinistického hnutí. Herty Lewites, bývalý starosta Managua a jeho bratr Israel Lewite, vůdce sandinistů.
Odhaduje se, že komunita dosáhla svého demografického vrcholu v roce 1972, kdy měla 250 členů. Téhož roku však Managua zasáhlo zemětřesení a zničilo 90% města, což vedlo k emigraci mnoha Židů.
Po sandinistické revoluci režim zabavil část majetku komunity a uvěznil jejího prezidenta Abrahama Gorna, kterému se následně podařilo uprchnout a opustit zemi. Jediná synagoga byla zbořena a nahrazena školou. Ze strachu před vládními represálemi uprchla ze země téměř celá komunita; její členové se usadili hlavně ve Spojených státech , někteří provedli Aliyah v Izraeli a jiní se přesídlili jinde ve Střední Americe .
Poté, co se Daniel Ortega stáhl poté, co prohrál prezidentské volby v roce 1990, se do Nikaraguy vrátil malý počet Židů. Odhaduje se, že současná komunita má kolem 50 lidí, nemá v čele rabína a již nemá synagógu.
Centrum Chabad bylo otevřeno v roce 2011 v San Juan del Sur