Alpha varianta z SARS-CoV-2 , také nazývaný B.1.1.7 nebo dokonce VOC-202012/01 , nebo varianta koncernu 202012/01 , dříve VUI-202012/01 , také nazývané „ anglicky varianta “ nebo „ britský varianty „, Je variantou SARS-CoV-2 , koronaviru odpovědného za Covid-19 . Poprvé byl zjištěn vříjna 2020během pandemie Covid-19 ve Velké Británii ze vzorků odebraných v předchozím měsíci a rychle se šířily odprosince 2020. Jeho rozšíření souvisí s významným nárůstem počtu případů Covid-19 ve Velké Británii. Předpokládá se, že toto zvýšení je alespoň částečně způsobeno mutací N501Y S peplomeru viru ovlivňující doménu vázající receptor , nebo RBD (pro doménu vázající receptor ), schopnou vázat se na L- konvertující enzym. angiotensin 2 (ACE2) a zbytek z asparaginu je nahrazen tyrosinem v poloze 501.
Tyto mutace z SARS-CoV-2 jsou společné: více než 4000 mutace byly zjištěny vprosince 2020jen v S- glykoproteinu . Analýza mutací je běžným způsobem sledování šíření virů v populaci. Kromě toho, že byl například schopen prokázat, že se SARS-CoV-2 ve Velké Británii rozšířil z tisíce vstupních bodů, také ukázal, že varianta nesoucí mutaci G614 zcela nahradila kmeny nesoucí D614 mutace.
Varianta VOC-202012/01 se vyznačuje 23 mutacemi:
nebo 17 mutací indukujících změnu aminokyselin v proteinech přeložených z virové RNA .
V únoru 2021 se mutace E484K, která má vliv na špičkový protein viru, čímž se podobá jihoafrickým a brazilským variantám, šíří hlavně na jihozápadě Anglie a znepokojuje vědce.
Britští vědci NERVTAG (ne) naznačují18. prosince 2020že se vší pravděpodobností je varianta VOC-202012/01 výrazně nakažlivější než ostatní. Data, která mají k dispozici, však nejsou dostatečná k vysvětlení základního mechanismu této zvýšené přenositelnosti, rozdělení případů podle věku nebo závažnosti případů. Odhadují, vzhledem ke zdvojnásobení relativní prevalence této varianty každých 6,4 dne, že je dvakrát nakažlivější než původní virus s koeficientem selekce 70%. Rovněž identifikují korelaci mezi vyšší rychlostí reprodukce a detekcí varianty B.1.1.7.5. I když mohou existovat další vysvětlení, je pravděpodobné, že tato korelace vychází z větší přenositelnosti této varianty; laboratorní analýzy by měly tento bod objasnit.
Jednou z nejvýznamnějších mutací varianty VOC-202012/01 je N501Y. Tato mutace ovlivňuje motiv vázající se na receptor nebo RBM (pro motiv vázající se na receptor ), skupinu zbytků RBD, které přicházejí do přímého kontaktu s lidským ACE2 . Mutace na této úrovni modifikují rozpoznávání protilátek a vazebnou specificitu S peplomeru k ACE2.
NERVTAG odhaduje 18. prosince 2020že není dostatek údajů k závěru o závažnosti Covid-19 vyvolané variantou SARS-CoV-2 VOC-202012/01 . Britské úřady druhý den naznačují, že k uvedenému datu neexistují žádné důkazy o tom, že nová varianta viru je smrtelnější nebo že reaguje odlišně na vakcíny nebo léčbu.
Sekvenční varianty VOC-202012/01 vykazovaly mutaci Q27stop - nahrazení zbytku glutaminu v poloze 27 pomocí kodonů zastávky - což zkrátí protein z ORF8 ( otevřeného čtecího rámce n o 8), nebo ji činí neaktivní. V dřívější studii, varianty z SARS-CoV-2 chybí geny otevřeného čtecího rámce n o 8 bylo spojeno s mírnými symptomy a lepší prognózu .
Delece v pozicích 69-70 ze S- glykoproteinu byla pozorována „u virů, které obcházejí imunitní odpověď některých pacientů s oslabenou imunitou“ , a bylo také zjištěno, „v kombinaci s jinými modifikacemi povodí“ .
Konec 2020bylo vyvíjeno nebo již bylo používáno několik vakcín proti Covid-19. Většina z nich cílí na S- glykoprotein jako hlavní antigen a varianta SARS-CoV-2 VOC-202012/01 má na tomto proteinu několik mutací . Nicméně, imunitní systém produkuje protilátky, cílení na několik oblastí tohoto proteinu v reakci na tyto vakcíny, takže je nepravděpodobné, že mutace v S peplomer bude mít vliv na účinnost těchto vakcín. Hromadění mutací však může vyžadovat úpravu vakcín. Například SARS-CoV-2 mutuje pomaleji než chřipkové viry , takže účinné vakcíny končí 2020 jsou ty, které lze v případě potřeby upravit.
V únoru 2021 byli vědci znepokojeni mutací britské varianty E484K, která se vyskytovala hlavně na jihozápadě Anglie a která by mohla ovlivnit účinnost vakcín.
Případ podle země (aktualizováno 14. července 2021) GISAID | ||
---|---|---|
Země | Potvrzené případy | Poslední nahlášený případ |
Spojené království | 266,195 | 27. června 2021 |
Kanada | 226,246 | 6. července 2021 |
Spojené státy | 201,185 | 29. června 2021 |
Německo | 101 697 | 28. června 2021 |
Dánsko | 59 856 | 29. června 2021 |
Švédsko | 56,325 | 21. června 2021 |
Francie | 32 208 | 28. června 2021 |
Holandsko | 27 660 | 25. června 2021 |
Japonsko | 27 404 | 1. července 2021 |
Itálie | 24 075 | 30. června 2021 |
švýcarský | 21 690 | 26. června 2021 |
Španělsko | 19 360 | 5. července 2021 |
Belgie | 20 355 | 1. července 2021 |
Polsko | 14 723 | 21. června 2021 |
Irsko | 14 875 | 23. června 2021 |
Litva | 9,208 | 11. června 2021 |
Izrael | 8,019 | 24. června 2021 |
Norsko | 8 056 | 23. června 2021 |
Slovinsko | 7930 | 20. června 2021 |
Finsko | 5 865 | 25. května 2021 |
Řecko | 5,440 | 7. června 2021 |
Portugalsko | 4,961 | 23. června 2021 |
Slovensko | 4,206 | 19. června 2021 |
Lucembursko | 3975 | 25. května 2021 |
Chorvatsko | 3,941 | 11. června 2021 |
Rakousko | 3 666 | 20. června 2021 |
Česká republika | 3831 | 24. června 2021 |
Indie | 3812 | 1. června 2021 |
Lotyšsko | 3145 | 28. května 2021 |
Estonsko | 2842 | 8. května 2021 |
Bulharsko | 2889 | 17. května 2021 |
Mexiko | 1476 | 24. června 2021 |
Thajsko | 736 | 20. června 2021 |
Rumunsko | 646 | 15. června 2021 |
Filipíny | 1027 | 30. března 2021 |
krocan | 606 | 25. května 2021 |
Jižní Korea | 589 | 8. června 2021 |
Aruba | 549 | 16. června 2021 |
Brazílie | 496 | 1. června 2021 |
Austrálie | 500 | 4. července 2021 |
Keňa | 452 | 3. června 2021 |
Kambodža | 348 | 26. června 2021 |
Svatý Martin | 334 | 24. června 2021 |
Rusko | 331 | 12. června 2021 |
Curacao | 311 | 19. května 2021 |
Srí Lanka | 321 | 25. června 2021 |
Ghana | 367 | 24. dubna 2021 |
Severní Makedonie | 249 | 22. dubna 2021 |
Katar | 257 | 23. května 2021 |
Singapur | 189 | 17. června 2021 |
Pákistán | 180 | 28. května 2021 |
Bonaire | 174 | 15. června 2021 |
Kazachstán | 174 | 27.dubna 2021 |
Nový Zéland | 150 | 14. června 2021 |
Malta | 148 | 11. června 2021 |
Chile | 155 | 12. června 2021 |
Nigérie | 143 | 19. března 2021 |
Jižní Afrika | 166 | 17. června 2021 |
Gibraltar | 131 | 8. března 2021 |
Argentina | 126 | 7. května 2021 |
Ekvádor | 147 | 17. června 2021 |
Čína | 116 | 7. června 2021 |
Kanárské ostrovy | 110 | 10. března 2021 |
Maroko | 101 | 22. dubna 2021 |
Kostarika | 115 | 24. května 2021 |
Bangladéš | 91 | 8. června 2021 |
Kolumbie | 87 | 25. května 2021 |
Jordán | 81 | 4. května 2021 |
Bosna a Hercegovina | 66 | 21. června 2021 |
Irák | 70 | 9. března 2021 |
Guadeloupe | 70 | 8. června 2021 |
Setkání | 60 | 8. června 2021 |
Angola | 58 | 23. dubna 2021 |
Gambie | 53 | 25. března 2021 |
Indonésie | 56 | 28. června 2021 |
Ukrajina | 52 | 18. března 2021 |
Írán | 52 | 8. května 2021 |
Bahrajn | 51 | 14. června 2021 |
Francouzská Guyana | 44 | 22. května 2021 |
Guam | 39 | 11. května 2021 |
Gabon | 35 | 5. května 2021 |
Guinea Bissau | 33 | 5. února 2021 |
Tchaj-wan | 32 | 29. května 2021 |
Džibuti | 62 | 31. března 2021 |
Maďarsko | 29 | 26. února 2021 |
Albánie | 27 | 11. března 2021 |
Palestina | 27 | 9. dubna 2021 |
Vietnam | 26 | 6. května 2021 |
Gruzie | 23 | 6. dubna 2021 |
Srbsko | 23 | 11. března 2021 |
Kuvajt | 25 | 5. června 2021 |
Martinik | 22 | 25. května 2021 |
Jít | 21 | 25. února 2021 |
Spojené arabské emiráty | 21 | 29. prosince 2020 |
Barbados | 20 | 21. května 2021 |
Island | 20 | 5. ledna 2021 |
Svatá Lucie | 20 | 29.dubna 2021 |
Senegal | 24 | 30.dubna 2021 |
Uganda | 17 | 15. června 2021 |
Libanon | 16 | 3. května 2021 |
Pobřeží slonoviny | 15 | 9. března 2021 |
Jamaica | 15 | 12. února 2021 |
Surinam | 15 | 14. května 2021 |
Arménie | 14 | 18. března 2021 |
Kamerun | 14 | 17. dubna 2021 |
Egypt | 13 | 17. května 2021 |
Guinea | 12 | - |
Malajsie | 11 | 4. června 2021 |
Nepál | 11 | 2. června 2021 |
Kypr | 10 | 27. ledna 2021 |
Wallis a futuna | 10 | 19. dubna 2021 |
Trinidad a Tobago | 9 | 4. května 2021 |
Demokratická republika Kongo | 8 | 28. března 2021 |
Dominikánská republika | 8 | 14. dubna 2021 |
Peru | 15 | 7. dubna 2021 |
Lichtenštejnsko | 7 | 16. května 2021 |
Černá Hora | 7 | 21. ledna 2021 |
Rwanda | 7 | 21. května 2021 |
Antigua a Barbuda | 5 | 6. května 2021 |
Kajmanské ostrovy | 5 | 15. května 2021 |
ostrovy Turks a Cacois | 5 | 22. března 2021 |
Dominika | 4 | 1. dubna 2021 |
Paraguay | 4 | 8. dubna 2021 |
Porto Rico | 4 | 11. června 2021 |
Ázerbajdžán | 3 | 7. února 2021 |
Bělorusko | 3 | 24. února 2021 |
Burkina Faso | 3 | 3. února 2021 |
Etiopie | 3 | 4. února 2021 |
Kosovo | 3 | 6. ledna 2021 |
Malta | 3 | 10. června 2021 |
Moldavsko | 3 | 3. března 2021 |
Monako | 3 | 17. dubna 2021 |
Konžská republika | 4 | 5. března 2021 |
Tunisko | 7 | 8. března 2021 |
Anguilla | 2 | 23. března 2021 |
Bermudy | 2 | 5. ledna 2021 |
Středoafrická republika | 2 | - |
Faerské ostrovy | 2 | 4. května 2021 |
Granát | 2 | 8. dubna 2021 |
Malawi | 2 | 8. března 2021 |
Mayotte | 2 | 21. května 2021 |
Montserrat | 2 | 5. února 2021 |
Myanmar | 2 | 28. května 2021 |
Somálsko | 6 | 5. března 2021 |
Zambie | 2 | 11. února 2021 |
Belize | 1 | 20. ledna 2021 |
Britské Panenské ostrovy | 1 | 19. dubna 2021 |
Rovníková Guinea | 1 | 9. února 2021 |
Guatemala | 1 | 7. dubna 2021 |
Haiti | 1 | 19. května 2021 |
Honduras | 1 | 23. dubna 2021 |
Mauricius | 1 | 10. ledna 2021 |
Mosambik | 1 | 21. dubna 2021 |
Severní Mariany | 1 | 29.dubna 2021 |
Omán | 30 | 22. prosince 2020 |
Saudská arábie | 1 | 15. dubna 2021 |
Niger | 1 | 9. ledna 2021 |
Libye | 1 | 5. června 2021 |
Jižní Súdán | 1 | 3. dubna 2021 |
Burundi | 1 | 27. května 2021 |
Svět (160 zemí) | Celkem: 1208 985 | Celkem k 14. červenci 2021 |
Prvním případem byl pravděpodobně případ osoby identifikovanézářív Kentu ve Velké Británii. Následně bylo identifikováno více než tisíc případůprosince 2020ve Spojeném království, zejména na jihovýchodě Anglie . Další případy byly zjištěny ve Walesu a ve Skotsku . Asi čtvrtina případů Covid-19 v Londýně (v) byla způsobena začátkem nové variantylistopadpodíl, který dosáhl třetího začátku prosinec ; odhadovali jsmeprosinecže 60% případů Covid-19 v Londýně bylo způsobeno touto novou variantou. V20. prosince, bylo zjištěno devět případů VOC-202012/01 v Dánsku , čtyři v Belgii a jeden v Nizozemsku , Austrálii a Itálii . Brzy poté, co tato varianta byla také nalezena v Islandu a Gibraltar , pak v Singapuru , Izraeli a Severního Irska na23. prosince, v Německu a Švýcarsku dne24. prosincea v Irsku , Japonsku a Francii dne25. prosince. Konecprosince 2020„Britská varianta se rozšířila zejména v Evropě , Severní Americe ( Kanada , USA ), Asii ( Jižní Korea ), Jižní Americe ( Chile ) a jižní Asii ( Indie ).
Tato varianta, považovaná za o 50 až 70% nakažlivější, rychle získává výhodu oproti původnímu viru ve Francii: představuje 35% virů cirkulujících ve Francii nebo ve Spojených státech v polovině března 2021 a představuje téměř všechny případy zjištěné v začátkem května.