Virus citrusové lepry C.
Virus citrusové lepry C.| Království | Riboviria |
|---|---|
| Panování | Orthornavirae |
| Větev | Kitrinoviricota |
| Třída | Alsuviricetes |
| Objednat | Martellivirales |
| Rodina | Kitaviridae |
| Druh | Cilevirus |
Citrus leprosis virus C (CiLV-C, citrus leprosis virus C ) je jedním ze dvou virových druhů zev rodu Cilevirus . Jsou kladná polarita jednovláknové lineární RNA viry , přiřazené skupině IV na klasifikaci Baltimore . Hostiteli jsou zejména rostliny rodu Citrus ( citrus ), zejména pomerančovníku ( Citrus sinensis ). Tento virus se přenáší roztoči rodu Brevipalpus .
Tento virus je jedním z původců citrusové lepry hlášené pouze v Jižní a Střední Americe .
Celý genom CiLV-C byl sekvenován v roce 2006. Toto je oddělené od genomu jiných známých virů, CILV-C byl klasifikován do nového rodu, Cilevirus , vytvořeného pro tento účel.
Virová částice CiLV-C (nebo virion ) je baciliformního typu , neobalená, asi 150 nm dlouhá a 50 nm široká, podobná těm příbuzného rodu Higreviruses .
Genom je bipartitní a skládá se ze dvou pozitivních jednořetězcových molekul RNA , RNA1 a RNA2, dlouhých 8745 a 4986 nukleotidů , které mají šest otevřených čtecích rámců (ORF).
RNA1 obsahuje dva ORF kódující RNA-dependentní RNA polymerázu (RdRp) a domnělý kapsidový protein (P29). RNA1 pohání transkripci o 0,7 kb subgenomové RNA (sgRNA) pro expresi genu P29.
RNA2 má čtyři ORF kódující putativní pohybový protein (MP) a proteiny P15, P61 a P24, jejichž funkce nejsou známy. Zatímco ORF P15 je považován za osiřelý gen, bez homologu u jakéhokoli jiného virového druhu, ORF P61 a P24 jsou také přítomny ve virech podobných negatevirům infikujícím hmyz . RNA2 generuje tři coterminální sgRNA o velikosti 3, 1,5 a 0,6 kb, z nichž se provádí transkripce genů P61, MP a P24.
Virus citrusové leprosy C se přenáší pouze roztoči rodu Brevipalpus , včetně Brevipalpus phoenicis .
Je to atypický virus, protože na rozdíl od většiny virů infikujících rostliny se nešíří systémově mezi hostiteli. Když je naočkován vektorovými roztoči, způsobí lokální léze a infekce zůstává omezena na buňky v blízkosti kousacích bodů roztoče. Absence systémové infekce je však častá u virů rodiny Kitaviridae .
Neschopnost CiLV-C způsobit systémovou virovou infekci u rostlin zůstává nevysvětlitelná. Mohlo by to být způsobeno vadnými faktory virového pohybu, účinným imunitním systémem rostlin, který CiLV-C není schopen obejít, nebo kombinací těchto a dalších neznámých faktorů.
Oranžový ( Citrus sinensis ) jsou hlavními druhy hostitelských rostlin z CiLV-C v přirozených podmínkách. Mohou být infikovány i jiné citrusové druhy ( Citrus sp.), Ale jsou mnohem méně náchylné, zejména citrónové stromy ( Citrus limon ), mandarinky ( Citrus reticulata , Citrus × reshni , Citrus deliciosa ), grapefruity ( Citrus × paradisi ) a hybridy. O žádném jiném rostlinném druhu nebylo známo, že by působil jako přirozený hostitel tohoto viru, než bylo zjištěno, že tuto roli mohou hrát plevele přítomné v pomerančových hájích, jako je například Commelina benghalensis v Brazílii (2012) a Swinglea glutinosa v Kolumbii (2008).
Experimentální infekce však byly prováděny mechanickým očkováním u různých druhů rostlin, což způsobilo lokální léze, ale pokusy o přenos viru na citrusové plody z těchto rostlin selhaly.
Podle NCBI (28. prosince 2020) :