Virus Lassa

Virus Lassa Popis tohoto obrázku, také komentován níže Transmisní elektronové mikroskopie z virionů viru Lassa. Klasifikace
Typ Virus
Pole Riboviria
Větev Negarnaviricota
Dílčí embr. Polyploviricotina
Třída Ellioviricetes
Objednat Bunyavirales
Rodina Arenaviridae
Druh Mammarenavirus

Druh

Mammarenavirus Lassa
ICTV

Fylogenetická klasifikace

Pozice:

Virus Lassa , také známý jako virus Lassa je infekční agens původně od člověka , z horečky Lassa , hemoragické horečky endemický do západní Afriky , kde, ačkoli to má rychlost s průměrnou smrtonosnosti kolem 1%, to je příčinou smrtelné epidemie kvůli jeho vysoké prevalenci - 300 000 až 500 000  případů, které v regionu každoročně způsobí 5 000 úmrtí. Jedná se o RNA virus s jednoduchým řetězcem z polarity ambisense do genomu bisegmenté patří do rodiny z Arenaviridae , druh Mammarenavirus . Jeho přirozeným rezervoárem je Mastomys natalensis nebo běžná africká krysa rozšířená po celé subsaharské Africe .

Genom a replikace

Genom tohoto virus s obalem se skládá ze dvou RNA segmentů které každý kódují dva proteiny , jeden v každém směru, tedy celkem čtyři proteiny. Velký segment, dlouhý 7  kilobází , kóduje v pozitivním směru malý protein zinkového Z prstu 11  kDa, který reguluje transkripci a replikaci  ; v negativním směru kóduje RNA-dependentní L RNA polymerázu 200 kDa. Malý segment, dlouhý 3,4  kb , kóduje v pozitivním směru GP prekurzor 75 kDa povrchových glykoproteinů , prekurzor poté štěpený proteolýzou na dva obalové glykoproteiny GP1 a GP2, které se vážou na alfa - receptor. Dystroglycan (en) (α-DG) a umožnit viru vstoupit do hostitelské buňky  ; v negativním směru kóduje 63 kDa NP nukleoprotein .  

Způsob replikace viru Lassa probíhá v po sobě jdoucích fázích, které přispívají k imunosupresi . Vzhledem k ambisenční povaze genomu tohoto viru jeho replikace nejprve produkuje velké množství kopií komplementárního RNA virového genomu používaného k masivní expresi proteinů kódovaných v negativním směru, tj. Řekněme NP nukleoprotein a RNA závislá RNA polymeráza L Virový genom se poté transkribuje identicky na původní virus z tohoto komplementárního genomu, aby se dokončila replikace viru , což umožňuje masivní expresi proteinů kódovaných v pozitivním smyslu, tj. Protein Z se zinkovým prstem a prekurzor glykoproteinu GP, který má ještě není štěpeno na GP1 a GP2. Jedná se tedy vyrábí poslední, oddálení všechny identifikaci viru v imunitním systému na hostitele , což způsobuje imunosupresi pozorované v případech horečky Lassa .

Sekvenování genomu viru Lassa prokázalo existenci čtyř kmenů  : tři v Nigérii , čtvrtý v Guineji , Libérii a Sierra Leone  ; zdá se, že nigerijské kmeny předcházely druhému, i když tento výsledek vyžaduje potvrzení.

Způsob infekce

Virus Lassa vstupuje do buněčného hostitele prostřednictvím receptorů α- DG  (in) . Rozpoznání receptoru závisí na konkrétní změně, která se odváží a-DG specificky podle glykosyltransferázy . Specifické varianty genů kódujících tyto proteiny jsou zvláště přítomné v západní Africe, kde je endemická horečka Lassa . Přítomnost v poloze 260 je zbytkem z amino kyselin alifatických na glykoprotein GP1 je nezbytná pro afinitu jeho na alfa-DG. Povaha předchozího zbytku (v poloze 259) se také jeví jako rozhodující, protože všechny viry rodu Arenavirus, které vykazují vysokou afinitu k α-DG, mají zbytek, který má v této poloze aromatický postranní řetězec - tyrosin nebo fenylalanin .

Na rozdíl od většiny obalených virů , které používají klatrinem vyplněné dutiny k proniknutí do svého hostitele a k vazbě na svůj receptor způsobem závislým na pH , virus Lassa sleduje cestu endocytózy nezávislou na klatrinu , kaveolinu , dynaminu a aktinu . Jakmile se virové částice dostanou do buňky, rychle si vezikulární cirkulací najdou cestu do endozomů . Fúze virového obalu s vesikulární membrány dochází prostřednictvím interakce na virového glykoproteinu GP2 s lysozomální proteinu LAMP1 (en) pod vlivem kyselého pH endozomu. Pochopení mechanismů, které jsou základem konformačních změn vyvolaných vazbou virového glykoproteinu na jeho receptor, jakož i fúzí membrán, je předmětem výzkumu s cílem vyvinout vakcínu proti horečce Lassa .  

Vzhledem k biologickému nebezpečí, které představuje, lze s virem Lassa manipulovat pouze v laboratoři P4 nebo BSL-4 .

Poznámky a odkazy

  1. (in) „  Virus Taxonomy: Release 2018b  “ , ICTV , července 2018(zpřístupněno 6. července 2019 ) .
  2. (in) Catherine Houlihan a Ron Behrens , „  horečka Lassa  “ , The BMJ , sv.  358, 12. července 2017Článek n o  j2986 ( PMID  28701331 , DOI  10,1136 / bmj.j2986 , číst on-line )
  3. (in) Tatjana I. Cornu a Juan Carlos de la Torre , „  Prstový protein RING z lymfocytární choriomeningitidy viru (LCMV) inhibuje transkripci a RNA replikaci minigenomu LCMV S-segmentu  “ , Journal of Virology , sv.  75, n o  19, Říjen 2001, str.  9415-9426 ( PMID  11533204 , PMCID  114509 , DOI  10.1128 / JVI.75.19.9415-9426.2001 , číst online )
  4. (in) Mahmoud Djavani, Igor S. Lukashevich, Anthony Sanchez, T.Nichol Stuart a Maria S. Salvatoa , „  Dokončení sekvence viru horečky Lassa a identifikace otevřeného čtecího rámce prstence na prstenu 5 RNA na konci  “ , Virology , roč.  235, n O  2 Září 1997, str.  414-418 ( PMID  9281522 , DOI  10.1006 / viro.1997.8722 , číst online )
  5. (en) Wei Cao, Michael D. Henry, Persephone Borrow, Hiroki Yamada, John H. Elder, Eugene V. Ravkov, Stuart T. Nichol, Richard W. Compans, Kevin P. Campbell a Michael BA Oldstone , „  Identifikace α-dystroglykanu jako receptoru pro virus lymfocytární choriomeningitidy a viru Lassa Fever  “ , Science , sv.  282, n O  5396, 11. prosince 1998, str.  2079-2081 ( PMID  9851928 , DOI  10.1126 / science.282.5396.2079 , Bibcode  1998Sci ... 282.2079C , číst online )
  6. (in) Nadezhda E. Yun a David H. Walker , „  Patogeneze horečky Lassa  “ , viry , krádež.  4, n o  10, 9. října 2012, str.  2031-2048 ( PMID  23202452 , PMCID  3497040 , DOI  10.3390 / v4102031 , číst online )
  7. (in) Meike Hass Uta Gölnitz, Stefanie Müller, Beate Becker-Ziaja a Stephan Günther , „  Replicon System for Lassa virus  “ , Journal of Virology , sv.  78, n o  24, prosince 2004, str.  13793-13803 ( PMID  15564487 , PMCID  533938 , DOI  10.1128 / JVI.78.24.13793-13803.2004 , číst online )
  8. (in) Michael D. Bowen, Pierre E. Rollin, Thomas G. Ksiazek, Heather L. Hustad, Daniel G. Bausch, Austin H. Demby, Mary D. Bajani Clarence J. Peters a Stuart T. Nichol , „  Genetic Rozmanitost mezi kmeny viru Lassa  “ , Journal of Virology , sv.  74, n o  15, srpna 2000, str.  6992-7004 ( PMID  10888638 , PMCID  112216 , DOI  10.1128 / JVI.74.15.6992-7004.2000 , číst online )
  9. (in) Christina F. Spiropoulou Stefan Kunz, Pierre E. Rollin, Kevin P. Campbell a Michael BA Oldstone , „  Nový svět Arenavirus Clade C, ale ne viry Clade A a B, využívá α-Dystroglycan jako svého hlavního receptora  “ , Journal of Virology , sv.  76, n o  10, Květen 2002, str.  5140-5146 ( PMID  11967329 , PMCID  136162 , DOI  10.1128 / JVI.76.10.5140-5146.2002 , číst online )
  10. (in) Sundaresh Shankar, R. Landon Whitby, Hedi E. Casquilho-Grey, Joanne York, Dale L. Boger a Jack H. Nunberg , „  Fúze malých molekulárních inhibitorů váže stabilní pH peptid-podjednotku signálního rozhraní GP2 glykoproteinu viru Lassa Envelope  “ , Journal of Virology , sv.  90, n o  15, srpna 2016, str.  6799-6807 ( PMID  27194767 , DOI  10.1128 / JVI.00597-16 , Bibcode  4944282 , číst online )
  11. (in) Christine E. Hülseberg Lucie Feneantová Katarzyna M. a Judith Szymańska, pan White , „  Lamp1 zvyšuje účinnost infekce virem Lassa fúzí při podpoře méně kyselých endozomálních kompartmentů  “ , mbio , sv.  9, n o  1, Leden-únor 2018, e01818-17 ( PMID  29295909 , PMCID  5750398 , DOI  10.1128 / mBio.01818-17 , číst online )
  12. (in) Hadas Cohen-Dvashi, Hadar Israel, Orly Shani, Aliza Katz a Ron Diskin , „  Role of LAMP1 Binding and pH Sensing by the Spike Complex of Lassa virus  “ , Journal of Virology , sv.  90, n o  22, 15. listopadu 2016, str.  10329-10338 ( PMID  27605678 , PMCID  5105667 , DOI  10.1128 / JVI.01624-16 , číst online )
  13. (in) Kathryn M. Hastie, Michelle A. Zandonatti, Lara M. Kleinfelter, Megan L. Heinrich, Megan Rowland, Kartik Chandran, pan Luis Branco, James E. Robinson, Robert F. Garry a Erica Ollmann Saphire , “  Strukturální základ pro neutralizaci viru Lassa zprostředkovanou protilátkami  “ , Science , sv.  356, n O  6341, 2. června 2017, str.  923-928 ( PMID  28572385 , PMCID  6007842 , DOI  10.1126 / science.aam7260 , Bibcode  2017Sci ... 356..923H , číst online )
  14. (in) „  Biologická bezpečnost v mikrobiologických a biomedicínských laboratořích, 5. vydání  “ , CDC , prosince 2009(zpřístupněno 7. července 2019 ) .
  15. (in) Oddíl VIII - Souhrnná prohlášení agentů , CDC , 2009.