Haloquadratum walsbyi

Haloquadratum walsbyi Popis obrázku Haloquadratum walsbyi00.jpg. Klasifikace
Panování Archaea
Větev Euryarchaeota
Třída Halobakterie
Objednat Halobakterie
Rodina Halobacteriaceae
Druh Haloquadratum

Druh

Haloquadratum walsbyi
Burns a kol. , 2007

Synonyma

Haloquadratum walsbyi se o druh z halofilní fototrofní archaea tvoří v současné době ( 30. června 2013) jediný druh rodu Haloquadratum . Je velmi neobvyklý v tom, že má dokonale čtvercové ploché buňky .

Tyto mikroorganismy byly pozorovány poprvé v roce 1980 o Brity , v P r  Anthony E. Walsby, ze vzorků odebraných v Sabkha Gavish, a solankou jezera v jižní Sinai , v Egyptě , a byly popsány v roce 2007 formálně Burns et al. . Jsou obecně hojné ve většině slaných prostředí. Pokusy o jejich pěstování byly neúspěšné až do roku 2004 a současně vedly k identifikaci Haloarcula quadrata , dalšího druhu hranatých archaea rodu Haloarcula , odlišného od Hqr. walsbyi , méně hojný a geneticky zcela odlišný.

Buňky jsou velké - 2 až 5  μm - ale velmi tenké - kolem 150  nm - a obvykle obsahují granule polyhydroxyalkanoátů , stejně jako velké množství refrakčních plynem plněných vakuol, které poskytují vztlak ve vodném prostředí a pravděpodobně přispívají k umístění buňky pro maximalizaci příjmu světla. Mohou se agregovat do listů o šířce až 40 μm , ale spojení mezi buňkami jsou křehká a lze je snadno přerušit.  

Tyto organismy lze nalézt v jakémkoli těle velmi slané vody. Během odpařování mořské vody , uhličitan vápenatý CaCO 3a síranu vápenatého CaSO 4nejdříve se vysráží , čímž se získá solanka bohatá na chlorid sodný NaCl. Pokud odpařování pokračuje, NaCl zase sraženin jako halite , opouštět solanky bohaté na chlorid hořečnatý MgCl 2. Hqr. walsbyi daří v průběhu závěrečné fáze halit srážek, před MgCl 2Sterilizuje solanku a může tvořit 80% biomasy tohoto média.

Genom z Hqr. walsbyi byl plně sekvenován , což poskytuje přístup k lepšímu pochopení fylogenetické a taxonomické klasifikace tohoto organismu, jakož i jeho role v ekosystému . Genomické srovnání španělských a australských izolátů (kmeny HBSQ001 a C23 T ) silně naznačuje rychlé celosvětové rozptýlení, protože jsou si pozoruhodně podobné a zachovávají si pořadí genů ( synteny ).

Skutečnost, že jeho laboratoř růst byl dosažen v prostředí s velmi vysokými koncentracemi chloridů (více než 2  mol · L -1 z MgCl 2a vyšší než 3  mol · l -1 z NaCl ) klasifikuje tohoto organismu mezi nejvíce haloresistant známé. Je rovněž třeba uvést, že jeho optimální kultivační teplota je 40  ° C .

Poznámky a odkazy

  1. (in) Reference NCBI  : haloquadratum walsbyi ( včetně taxonů ) .
  2. (in) Walther Stoeckenius , „  Walsbyho čtvercové bakterie: jemná struktura ortogonálního prokaryota  “ , Journal ofacteriology , sv.  148, n o  1, Říjen 1981, str.  352-360 ( číst online ) PMID 7287626 ..
  3. (in) David G. Burns, Peter H. Janssen, Takashi Itoh Masahiro Kamekura, Zhuo Li, Grant Jensen, Francisco Rodriguez-Valera, Henk Bolhuis a Mike L. Dyall-Smith , „  haloquadratum walsbyi gen. nov., sp. nov., čtvercový haloarchaeon Walsby, izolovaný ze solných krystalizátorů v Austrálii a Španělsku  “ , International Journal of Systematic and Evolutionary Microbioloby , sv.  57, n O  2 února 2007, str.  387-392 ( číst online ) DOI : 10.1099 / ijs.0.64690-0 ..
  4. (in) David G. Burns, Helen M. Camakaris, Peter H. Janssen a Mike L. Dyall-Smith , „  Cultivation of Walsby haloarchaeon's square  “ , FEMS Microbiology Letters , sv.  238, n O  2 Září 2004, str.  469-473 ( číst online ) DOI : 10.1111 / j.1574-6968.2004.tb09790.x PMID 15358434 ..
  5. (in) Aharon Oren, Nuphar Pri-El, Orr Shapiro a Nachshon Siboni , „  Studie vztlaku v přírodních společenstech naftových vakuolátových čtvercových archea v solných rybnících Crystallizer  “ , Saline Systems , sv.  2, n O  4, 14. dubna 2006( číst online ) DOI : 10.1186 / 1746-1448-2-4 PMID 16613609 ..
  6. (in) haloquadratum walsbyi DSM 16790 Stránka genomu na webu Komplexní mikrobiální zdroj JCVI . .
  7. (in) Mike L. Dyall-Smith, Friedhelm Pfeiffer, Kathrin Klee Peter Palm, Karin Gross, Stephan C. Schuster, Markus a Dieter Rampp Oesterhelt , „  haloquadratum walsbyi : Limited Diversity in a Global Pond  “ , PLoS ONE , let.  6, n O  6, 20. června 2011, e20968 ( číst online ) DOI : 10,1371 / journal.pone.0020968 ..