Inhibitor ribonukleázy je protein, asi 49 kDa , obsahující asi 450 zbytků z aminokyselin a mající isoelektrický bod kyseliny blízko 4,7. Jedná se o hojný protein, který tvoří asi 0,1% proteinové hmoty buněk a který hraje důležitou roli v regulaci životnosti RNA . Má pole pro leucinové repetice ( LRR ) tvořící zvláště silné komplexy s určitými ribonukleázami .
Tento protein má zvláště vysokou hladinu cysteinu asi 6,5%, ve srovnání s 1,7% obvykle v bílkovinách, a je citlivý na oxidaci . Má také vysokou hladinu leucinu kolem 21,5%, namísto 9% obecně tvořících proteiny, ale je výrazně horší v jiných hydrofobních zbytcích , zejména ve valinu , isoleucinu , methioninu , tyrosinu a fenylalaninu .
Inhibitor ribonukleázy je klasickým příkladem proteinové domény s bohatým opakujícím se leucinem, jehož sekundární struktura střídá helixy a listy β , které se ohýbají a vytvářejí solenoidní pravou podkovu. Tyto beta listy jsou organizovány paralelně uvnitř struktury, zatímco alfa helixy tvoří vnější. Zdá se taková struktura je stabilizována zbytky z asparaginu na základně každého ohybu , na přechodu mezi šroubovice alfa a prokluzu p . Ty mají délku 28, respektive 29 zbytků, tvořící strukturní jednotku 57 zbytků, která tvoří základní jednotku opakovanou v celé doméně LRR.
Afinita tohoto proteinu pro ribonukleázy patří mezi nejsilnější ze všech známých proteinových interakcí . Disociační konstanta komplexu vytvořený ribonukleázy inhibitorem a pankreatické ribonukleázy je femtomolární ( 1 fM = 10 -15 mol l -1 ) za fyziologických podmínek, a to vytvořený komplex se angiogeninu je nižší při 1 fM .
Inhibitor ribonukleázy se může vázat na různé typy pankreatických ribonukleáz navzdory relativní variabilitě jejich peptidové sekvence . Biochemické a krystalografické studie naznačují, že interakce proteinů s proteiny komplexů vytvořených inhibitorem ribonukleázy jsou převážně elektrostatické povahy, ale také zahrnují velké hluboké oblasti.
Afinita tohoto proteinu k ribonukleázám hraje důležitou fyziologickou roli, protože mnoho ribonukleáz má cytotoxický a cytostatický účinek silně korelovaný s jejich schopností vázat se na inhibitor ribonukleázy.
Savčí inhibitory ribonukleázy nemají afinitu k určitým pankreatickým ribonukleázám od jiných druhů . To je zejména případ některých ribonukleázy z obojživelníků , jako Ranpirnase / Onconase a amphinase na leopardí žáby , který dává těmto ribonukleázy určitou cytotoxicitu proti buňkám rakovinné .