Varianty SARS-CoV-2 Kappa a Delta

Tento článek je návrh týkající se zdraví .

O své znalosti se můžete podělit vylepšením ( jak? ) Podle doporučení příslušných projektů .

Tyto B.1.617 varianty , také nazýván G / 452R. V3 a často přezdívaná „  indická varianta  “ jsou varianty SARS-CoV-2 . Jsou poprvé identifikován v roce Maharashtra , Indie na5. října 2020. Jsou identifikovány v kladu 20A podle fylogenetického klasifikačního systému Nextstrain . B.1.617.1 sublinie se nazývá Kappa varianta podle WHO , a B.1.617.2 sublinie je varianta Delta .

"Dvojitý mutant"

Zjištěno 5. října 2020u Nagpur v Indii se B.1.617 (0,1) varianta má 15 mutací , z nichž dva mají vliv na vazebnou doménu z spicular proteinu  :

Tyto poslední dvě mutace jsou znepokojující, protože by jí mohly umožnit únik z protilátek (po infekci nebo vakcínách). Vysloužili si - nevhodného - kvalifikátor „dvojitého mutanta“.

the 10. května 2021, tato varianta B.1.617 byla WHO klasifikována jako „vzbuzující obavy“ . 11. května 2021, WHO poznamenává, že „mezi těmito třemi podřádkami mohou existovat značné rozdíly“, ale „data, která jsou v současné době k dispozici, jsou příliš omezená“, aby je bylo možné odlišit.

V Indii jsou hlášeny případy mukormykózy u pacientů uzdravených z Covid-19. Zdá se však, že právě konjunktura diabetu 2. typu a terapie kortikosteroidy oslabuje imunitní systém, který podporuje slizniční infekci, a nikoli samotný virus SARS-CoV-2 .

the 31. května 2021WHO přijímá řecká písmena k pojmenování nejdůležitějších variant, nahrazuje jejich geografický původ a potenciálně stigmatizuje:

Varianta Delta se odehrává v Evropě ( 4 th vlna) na úkor různé Alpha . Je charakterizována:

Rozpětí

v Dubna 2021, rozšířila se do nejméně osmi zemí. Zprávy z terénu to popisují jako nakažlivější.

Public Health France píše dále 8. dubna 2021 : „Tato varianta byla sporadicky detekována v Anglii , Německu , Kanadě a Singapuru . Na Guadeloupe byly zjištěny dva případy . "

Koncem dubna se ukazuje, že tato varianta koluje po Fidži . Přivezli jej tam dva pacienti repatriovaní z Indie. Voják v karanténním centru se pak nakazil dotykem jejich zavazadel. Poté nakazil uklízečku, která neinformovala úřady o klinických příznacích její nemoci, volně se pohybovala mimo karanténní centrum a nakazila mnoho dalších lidí.

the 29.dubna 2021Je regionální zdravotní orgán o Nouvelle-Aquitaine oznamuje, že indická varianta byla zjištěna poprvé ve Francii , v departmentu Lot-et-Garonne , u pacienta, který se vrátil z Indie . Druhý den generální ředitelství pro zdraví odhalilo, že v Bouches-du-Rhône byly zjištěny dva nové případy a že další podezřelé případy jsou vyšetřovány v jiných regionech, stále se účastní lidé z Indie .

v Květen 2021, některá média se domnívají, že takzvaná indická varianta je nakažlivější než takzvaná britská varianta. Ve Spojeném království představuje takzvaná britská varianta pouze 90% virů, které se šíří proti 10% pro takzvanou indickou variantu.

V 8. června 2021, Spojené království - v reakci na variantu Delta, která nahrazuje jiné varianty - oficiálně doporučuje omezit cestování na minimum. Varianta zdvojnásobuje počet lidí hospitalizovaných ve Velké Británii každý týden, z nichž 90% bylo neočkovaných dvěma dávkami.

v Června 2021, varianta pětinásobně každých čtrnáct dní počet lidí bleskově testovaných ve Francii, to znamená, že se každý týden vynásobí 2,2. the23. června 2021, Gabriel Attal , tisková mluvčí vlády ČR, oznamuje, že tato varianta představuje 9 až 10% kontaminantů ve Francii, ale že toto číslo je mnohem vyšší, v Landes oddělení , kde dosahuje 70%.

Ve Francii však hledáme spíše mutace než varianty. the28. června, mutace L452R se objevuje v 25,8% testů.

the 17. července„Šíření varianty delty ve Španělsku vede k nočním vězení v katalánských obcích s více než 5 000 obyvateli.

Následující den zavírá Pyrénées Orientales - francouzské oddělení vedle Katalánska - od 23:00 do 6:00 bary , restaurace , plážová zařízení , dočasná zařízení na pití a noční obchody s potravinami .

23. července dosáhla Occitania incidenci 200 na 100 000 a 651 na 100 000 mezi 20–29letými.

Problém související s kolektivní imunitou

Profesor JF Delfraissy9. června 2021vyhodnotil základní reprodukční číslo R 0 varianty Delta na 7,5. Úroveň kolektivní imunity nezbytná k tomu, aby se virus již nešířil, je proto 1-1 / R 0, tj. 87%.

Účinnost vakcín s variantou Delta

Účinnost vakcín klesá s variantou Delta. Podle britských a kanadských studií to je:

Účinnost vakcín Delta Variant
Vakcína Po 1 injekci Po 2 injekcích
AstraZeneca 30% 67%
Pfizer-BioNTech 36% 88%
Moderna 72% nd

Statistika

Případy hlášené podle zemí (aktualizováno 7. července 2021) GISAID
Země Potvrzené případy Datum sběru
Indie 3693 26. května 2021
Spojené království 517 31. května 2021
Spojené státy 299 24. června 2021
Kanada 266 12. května 2021
Irsko 170 8. června 2021
Austrálie 112 15. června 2021
Německo 106 22. června 2021
Singapur 59 13. května 2021
Dánsko 28 31. května 2021
Holandsko 27 12. června 2021
Japonsko 27 7. května 2021
Angola 24 20. dubna 2021
Francie 16 20. května 2021
Belgie 16 13. května 2021
Čína 13 18. dubna 2021
Katar 12 17. května 2021
Jižní Korea 12 27. dubna 2021
švýcarský 10 4. května 2021
Portugalsko 9 4. května 2021
Itálie 9 24. května 2021
Bahrajn 8 10. dubna 2021
Mexiko 8 2. června 2021
Jižní Afrika 8 18. června 2021
Finsko 7 23. května 2021
Lucembursko 6 26. dubna 2021
Španělsko 5 19. května 2021
Švédsko 5 17. dubna 2021
Ghana 5 20. dubna 2021
Keňa 5 29.dubna 2021
Česká republika 4 4. května 2021
Jordán 4 25. dubna 2021
Myanmar 4 2. června 2021
Nový Zéland 4 8. dubna 2021
Malajsie 4 1. června 2021
Indonésie 3 29.dubna 2021
Guadeloupe 2 10. března 2021
Malawi 2 30.dubna 2021
Nepál 2 9. května 2021
Svatý Martin 2 3. dubna 2021
Botswana 2 1. června 2021
Kuvajt 1
Rakousko 1
Kambodža 1 5. dubna 2021
Curacao 1 23. dubna 2021
Řecko 1 6. dubna 2021
Slovensko 1 19. dubna 2021
Slovinsko 1 6. dubna 2021
Thajsko 1 26. dubna 2021
Uganda 1 26. března 2021
Zambie 1 2. května 2021
Svět (50 zemí) Celkem: 5525 Celkem k 1. červenci 2021

Poznámky a odkazy

Poznámky

  1. Počet mutací není omezen na dvě a virus nemutoval dvakrát.
  2. Viz Černá houba (komplikace související s COVID-19)

Reference

  1. „  linie PANGO Lineage B.1.617  “ , cov-lineages.org (přístup 3. května 2021 )
  2. (in) „  Týdenní epidemiologická aktualizace Covid-19 (2. května 2021)  “ , reliefweb.int , Světová zdravotnická organizace (přístup k 6. května 2021 )
  3. (in) „  Sledování variant  “ , gisaid.org , GISAID ,26. dubna 2021(zpřístupněno 8. května 2021 )
  4. (in) „  Expertní reakce na krabice různého B.1.617 („ indická varianta “), které jsou bílé Vyšetřováno ve Velké Británii  “ , Science Media Center , Science Media Center (přístup 20. dubna 2021 )
  5. (in) „  Genomická epidemiologie nového koronaviru - globální podvzorkování (filtrováno na B.1.617)  “ , nextstrain.org (zpřístupněno 5. května 2021 )
  6. „  Alfa, Beta, Gamma ... KTE přejmenovává varianty Covid-19  “ , na liberation.fr ,1 st 06. 2021.
  7. „  Analýza rizik spojená s nově vznikajícími variantami SARS-CoV-2 prováděná společně CNR pro viry respiračních infekcí a Public Health France]  “ , na santepubliquefrance.fr ,8. dubna 2021
  8. „  Covid-19: co víme o variantě B.1.617 identifikované v Indii, jejíž první případy jsou hlášeny ve Francii  “ , France info,20. dubna 2021(přístup 17. července 2021 )
  9. (in) Starr, Greaney, Dingens a Bloom, „  Kompletní mapa mutací SARS-CoV RBD-2, které unikají monoklonální protilátce LY-CoV555 a jejímu koktejlu s LY-CoV016  “ , Cell Reports Medicine ,Dubna 2021, str.  100255 ( DOI  10.1016 / j.xcrm.2021.100255 )
  10. „  Co víme o indické variantě, tomto znepokojujícím„ dvojitém mutantovi “?  » , Ouest-Francie ,19. dubna 2021(přístup 17. července 2021 )
  11. Covid-19: indická varianta považovaná WHO za „více nakažlivou“ . Francie 24
  12. „  Koronavirus: co víme o indické variantě  “ , RTL,17. května 2021(přístup 17. července 2021 )
  13. Covid v Indii: tajemství „černé houby“ , proč doktore.
  14. DOI : 10,1051 / medsci / 201329s106
  15. Cyrielle Cabot, „  Indie:„ černá houba “, která postihuje pacienty s Covid-19, vyvolává obavy  “ , na france24.com ,14. května 2021(zpřístupněno 14. května 2021 )
  16. „  Covid: mutace, díky nimž je delta varianta viru nakažlivější a znepokojivější  “ , BBC News Brasil,12. července 2021(přístup 17. července 2021 )
  17. Osvobozením v 20:59 , „  Covid: Indie, od nerozvážnosti ke katastrofě  “ , na liberation.fr ,13. dubna 2021(zpřístupněno 14. dubna 2021 )
  18. (in) „Fidži upozorňuje na další lokální infekce Covid-19“ , Fidži Broadcasting Corporation, 27. dubna 2021
  19. (in) „Fidži musí zastavit Covid tsunami-19“ , Fidži Broadcasting Corporation, 27. dubna 2021
  20. „  Obava z indické varianty se šíří do Velké Británie  “ , na L'Express ,15. května 2021(přístup 16. května 2021 ) .
  21. (in) Lydia Stephens , „  Velká oblast Anglie říkala , aby se minimalizovalo cestování, jak se šíří varianta Delta  “ na WalesOnline ,8. června 2021(zpřístupněno 10. června 2021 )
  22. „  Covid-19 ve světě: varianta Delta na vzestupu ve Velké Británii, epidemie se šíří v Moskvě  “ , na Le Monde ,18. června 2021
  23. Covid-19 ve Francii: varianta Delta je stále „v menšině“, ale roste  ; datum = 18. června 2021; site = Svět .
  24. Robin Verner, „  Podle Gabriela Attala představuje delta varianta 70% znečištění v Landes  “ , na bfmtv.com ,23. června 2021(zpřístupněno 24. června 2021 )
  25. Covid-19: proč už během testů nehledáme varianty, ale mutace? , La Dépêche du Midi , 17. června 2021.
  26. Caroline Robin, „  Oddělení, kde nejvíce koluje varianta Delta, naše mapa Francie  “ , na Capital
  27. „  Španělsko: zákaz vycházení v Barceloně čelí výbuchu případů s variantou Delta  “ , na TV5 Monde ,16. července 2021(zpřístupněno 17. července 2021 ) .
  28. „  Covid-19: zavírání barů a restaurací ve 23 hodin od neděle v Pyrénées-Orientales  “ , na Le Figaro (konzultováno 17. července 2021 ) .
  29. https://www.ruthenois.com/2021/07/23/covid-19-le-variant-delta-progresse-de-facon-fulgurante-en-occitanie/
  30. „  Covid-19: čtvrtá vlna,„ odlišná “od těch předchozích, by mohla dorazit na začátku školního roku  “ , Midi Libre,9. června 2021(přístup 9. července 2021 )
  31. „  Vakcíny vysoce účinné proti variantě B.1.617.2 po 2 dávkách  “ , Public Health England,21. května 2021(přístup 21. července 2021 )
  32. „  Covid-19: to je stav, za kterého je vakcína Pfizer velmi účinná proti variantě Delta  “ , na Business Insider ,21. července 2021
  33. „  Zde je účinnost vakcín Covid-19 proti variantě Delta, podle nejlepších studií  “ , na Business Insider ,8. července 2021
  34. „  GISAID - varianty hCov19  “ , na www.gisaid.org (přístup 7. července 2021 )