Cytochrom c | ||
Struktura cytochromu c části buňky v myokardu z koně , ukazující hem koordinovanou s kationtem ze železa ( PDB 1HRC ) | ||
Hlavní rysy | ||
---|---|---|
Schválené jméno | Somatický cytochrom c | |
Symbol | CYCS | |
Synonyma | CYC, THC4, HCS | |
Funkce | Buněčné dýchání | |
Homo sapiens | ||
Místo | 7 s 15.3 | |
Molekulární váha | 11 749 Da | |
Počet reziduí | 105 aminokyselin | |
Pojď dovnitř | 54205 | |
HUGO | 19986 | |
OMIM | 123970 | |
UniProt | P99999 | |
RefSeq ( mRNA ) | NM_018947 | |
RefSeq ( protein ) | NP_061820.1 | |
Spolu | ENSG00000172115 | |
PDB | 1J3S , 2N9I , 2N9J , 3NWV , 3ZCF , 3ZOO | |
GENATLAS • GeneTests • GoPubmed • HCOP • H-InvDB • Treefam • Vega | ||
Odkazy přístupné z GeneCards a HUGO . |
Cytochrom c je malý hemoprotein obsahující sto zbytky z aminokyselin s hmotností asi 12 kDa . Je velmi rozpustný ve vodě v množství přibližně 100 g · L -1 za fyziologických podmínek, což ho odlišuje od ostatních cytochromů , které jsou spíše rozpustné v tucích .
Cytochrom c se podílí na buněčném dýchání na úrovni dýchacího řetězce , kde nese jeden elektron na molekulu. Za tímto účelem je spojen s vnitřní mitochondriální membránou a zajišťuje přenos elektronů mezi koenzymem Q - cytochrom c reduktáza ( komplex III ) a cytochrom c oxidázou ( komplex IV ). V lidí , je zakódován pomocí KMČ genu na chromozomu 7 .
Může také katalyzovat několik reakcí, jako jsou hydroxylace a aromatická oxidace , a také vykazuje aktivitu peroxidázy prostřednictvím oxidace různých donorů elektronů, jako je ABTS , kyselina 2-keto-4-thiomethylmaslová a 4-aminoantipyrin. Podílí se také na alespoň jedné formě nitritreduktázy .
A reaktivní dusíku , peroxynitrit může přímo reagovat s proteiny, které obsahují přechodných kovů center . Oxidací železného hemu na odpovídající železité formy může ovlivnit cytochrom c (stejně jako esenciální proteiny, jako je hemoglobin nebo myoglobin ).
Cytochrom c se může aktivně podílet na apoptóze . Aktivace mitochondriální apoptotické dráhy způsobí, že se objeví megapary umožňující cytochromu c přejít do cytosolu , kde se váže na aktivační faktor apoptotických proteáz (APAF1). To spouští kaskádu reakcí vedoucích k aktivaci kaspáz , proteolytických enzymů přímo odpovědných za fenomén apoptózy a ke tvorbě apoptosomu .
Cytochrom c je protein, který je vysoce konzervovaný u všech druhů , zejména u eukaryot , kde jsou rozdíly omezeny pouze na několik zbytků. Všechny cytochrom c studoval má standardní potenciál na 0,25 V , a je to například prokázáno, že cytochrom c oxidázy lidských reaguje s cytochromu c z pšenice . Sekvence z cytochromu c v lidech je totožný s tím na šimpanze , ale jinak, například od toho koně . Jeho velmi široká distribuce ve zvířatech , rostlinách a mnoha jednobuněčných rostlinách a také jeho malá velikost (12 kDa ) z něj činí nástroj volby pro kladistické studie zaměřené na stanovení fylogenetických vztahů mezi druhy v rámci biologie evoluce .
Cytochrom c Struktura cytochromu c 2 z Blastochloris viridis (en) ( PDB 1CRY )Pfam | PF00034 |
---|---|
InterPro | IPR003088 |
PROSITA | PDOC00169 |
SCOP | 1křik |
SUPERFAMILY | 1křik |
Rodina OPM | 78 |
OPM protein | 1 hod |
Pfam | PF01322 |
---|---|
InterPro | IPR002321 |
PROSITA | PDOC00169 |
SCOP | 1cgo |
SUPERFAMILY | 1cgo |
Pfam | PF02085 |
---|---|
Klan Pfam | CL0317 |
InterPro | IPR020942 |
SCOP | 2cdv |
SUPERFAMILY | 2cdv |
CDD | cd08168 |