Posttranslační modifikace

Post-translační modifikace je chemická modifikace proteinu , nejčastěji provádí pomocí enzymu , po jeho syntéze nebo v průběhu jeho životnosti v buňce. Obecně tato modifikace způsobuje změnu funkce dotyčného proteinu, ať už z hlediska jeho působení, jeho poločasu rozpadu nebo jeho buněčného umístění.

Přidání funkční skupiny

• acetylace nebo přidáním skupiny acetyl z acetyl-CoA , katalyzovanou malým množstvím enzymu (typ N-acetyl transferáza ), obvykle na N-terminální proteinu; nicméně tato modifikace, ke které dochází během syntézy proteinu, je v podstatě kotranslační, i když se obecně mylně považuje za posttranslační modifikaci;
• alkylace , je přidání skupiny alkyl , methyl nebo ethyl;
  • methylace je přidání skupiny methyl , obvykle na aminokyseliny lysinu nebo argininu .
  • méthylthiolation je přidání skupiny methylthio . Jediný případ, který je v současné době popsán v literatuře, je přítomen v poloze p postranního řetězce aspartátu 88 ribozomálního proteinu S12.
• biotinylační který je acylace lysinu pomocí biotinu skupinou.
• glutamylation , který je kovalentně spojující zbytek kyseliny glutamové na tubulinu nebo jiný protein.
• glycylation , který je kovalentní připojení jednoho nebo více (až 40), zbytky glycinu v části C-koncové tubulinu .
• glykosylace nebo přidání skupiny glykosyl zbytek, asparagin , hydroxylysin , serin nebo threonin , čímž se vytvoří glykoprotein .
• Hydroxylace , nebo přidáním hydroxylové skupiny na proteinu, obvykle na zbytek prolin nebo lysin , tvořící hydroxyprolin nebo hydroxylysin .
• isoprenylace , nebo přídavek isoprenoidní skupiny (tj farnesol nebo geranylgeraniol):
  • prenylace
  • myristoylaci
  • farnesylace
  • geranylgeranylace
• lipoylation
• phosphopantetheinylation , nebo přidání 4'-phosphopantetheinyl od koenzymu A .
• fosforylace , což je přidání skupiny fosfátu , obecně je serin , tyrosin , threonin nebo histidinu akceptoru.
• sulfatace , který je přidání skupiny síranu na tyrosin .
• selenace.
• amidace na C-konci.
• O-GlcNAcylace nebo přidání N- Acetylglukosaminu (běžně nazývaného O-GlcNAc) k serinovému nebo threoninovému zbytku .

Přidání peptidových skupin nebo proteinů

• ubikvitinace , který je kovalentní vazba ubikvitinu na lysinu akceptor.
• sumoylace , který je kovalentní vazba proteinu SUMO , obvykle na akceptorové lysinu.
• neddylation , který je kovalentní vazba proteinu Nedd8 na lysin akceptoru.
• urmylation .

Změna chemické povahy aminokyselin

• citrulinaci nebo deimination je přeměna argininu na citrulin .
• deamidace nebo konverzi glutaminu na kyselinu glutamovou nebo asparaginu na kyselinu asparagovou

Strukturální změny

• jsou disulfidové můstky vedoucí k chemické vazby SH skupin dvou cysteinů .
• Proteinové štěpení byla provedena proteázy části peptidové vazby .