Světová komunitní mřížka

Posláním projektu AfricanClimate @ Home je vyvinout přesnější klimatické modely pro určité regiony Afriky. Tyto modely budou sloužit jako základ pro lepší pochopení budoucího vývoje klimatu, aby bylo možné lépe implementovat opatření pro boj s dopady změny klimatu . Výpočetní síla sítě World Community Grid bude použita k pochopení a snížení současné nejistoty při simulaci klimatických procesů v Africe.

Posláním projektu Clean Energy je najít nové materiály pro novou generaci solárních článků a poté zařízení pro skladování energie. Vědci chtějí vypočítat elektronické vlastnosti stovek tisíc organických materiálů a určit nejslibnější kandidáty na vývoj cenově dostupné technologie solární energie. Během fáze 1 byly provedeny výpočty molekulárních mechanismů: během první fáze projektu byly výpočty určeny k pochopení toho, jak se hypotetické kandidátské molekuly seskupily za vzniku pevné látky (krystal, film, polymer atd.), A k předpovědi, zda tato pevná látka by měla vhodné elektronické vlastnosti pro použití v solárních článcích.

Posláním drogového projektu Společně objevujeme dengue je identifikovat slibné kandidáty na drogy v boji proti dengue, hepatitidě C, západním Nilu, žluté zimnici a dalším souvisejícím virům. Výpočty virtuálního screeningu musí být provedeny na strukturách nezbytných pro identifikaci těchto stop.

Hlavním cílem projektu Porovnání genomu je provést poprvé úplné srovnání všech předpovědí genetických sekvencí po jednotlivých párech a získat indexy podobnosti, které budou použity jako měřítko pro komunitu. což bude pro biology neocenitelným zdrojem. Program sekvenční podobnosti použitý v projektu Genome Comparison umožňuje najít matematicky optimální lokální zarovnání mezi dvojicemi sekvencí. Když vědci sekvenují nové genomy z jiných organismů, mohou je přidat do této databáze a vypočítat srovnání, čímž vědecké komunitě poskytnou nové informace.

Projekt Muscle Dystrophy Control studuje interakce mezi více než 2200 proteiny známé struktury se zaměřením na ty, které hrají roli v neuromuskulárním onemocnění . Získané informace budou shromážděny v databázi, aby pomohly vědcům navrhnout molekuly, které mohou inhibovat nebo podporovat vazbu konkrétních molekul. Cílem je být schopen najít léčbu proti myopatii a dalším neuromuskulárním patologiím .

Projekt Muscle Dystrophy Control studuje interakce mezi více než 2200 proteiny známé struktury se zaměřením na ty, které hrají roli v neuromuskulárním onemocnění . Získané informace budou shromážděny v databázi, aby pomohly vědcům navrhnout molekuly, které mohou inhibovat nebo podporovat vazbu konkrétních molekul. Cílem je být schopen najít léčbu proti myopatii a dalším neuromuskulárním patologiím .

World Community Grid bude umožní nejvíce zpracování energeticky náročných komponent Help Conquer Cancer projektu se běžet v optimálních otáčkách, a tím zvýšit přesnost a citlivost výpočtu výrazu a postupy uznávání. Diagramy. Využitím výpočetní síly Světové komunitní mřížky budou vědci schopni analyzovat mnohem větší sadu vzorků rakovinných tkání a experimentovat s mnohem větším počtem biomarkerů a skvrn, než by mohli s počítačovými prostředky. V současné době byla studována jen velmi malá část známých biomarkerů. Dlouhodobým cílem je vytvořit knihovnu biomarkerů a jejich vzorců exprese tak, aby ji v budoucnu mohli lékaři používat k diagnostice a zavádění nejúčinnější léčby pacientů s rakovinou.

Projekt Human Proteome Folding si klade za cíl poskytnout vědcům data pro předpovídání tvaru velkého počtu lidských proteinů. Tyto předpovědi poskytnou vědcům vodítka potřebná k identifikaci biologických funkcí specifických proteinů v lidském těle. Pochopením toho, jak každý protein ovlivňuje zdraví, budou vědci schopni vyvinout nové způsoby léčby lidských onemocnění, jako je rakovina, HIV / AIDS, SARS a malárie .

Cílem výzkumného projektu proti chřipce proti chřipce je najít nové léky, které mohou zastavit šíření chřipkové infekce v těle. Výzkum se zaměřuje zejména na chřipkové viry, které se staly rezistentními na léky a na nové viry, které se objeví. Určení, které chemické sloučeniny představují nejlepší kandidáty, urychlí úsilí o vývoj užitečné léčby pro zvládnutí sezónních ohnisek chřipky, jakož i budoucích epidemií a dokonce i pandemií .

Cílem projektu Feed the World with Rice je předpovědět proteinovou strukturu hlavních odrůd rýže s cílem pomoci farmářům pěstovat výživnější odrůdy rýže s vyššími výnosy, zvýšenou odolností vůči chorobám a proti parazitům a s využitím celé řady biologicky dostupných živin, zejména v oblastech trpících hladomorem, což by bylo prospěšné pro celé lidstvo. Stanovení struktury proteinů je obtížný a nákladný proces. Je však možné předpovědět bioinformatikou strukturu proteinu z jeho DNA sekvence . Skupina pro výpočetní biologii na University of Washington vyvinula nejmodernější software pro provádění těchto výpočtů. Potíž je v tom, že rýže obsahuje tisíce různých bílkovin. Ve spolupráci s agronomy a zemědělci se doufá, že se kvalita a celkový výnos rýže nakonec zlepší.

Posláním projektu pomoci porazit rakovinu je zlepšit výsledky krystalografického rentgenového proteinu, který pomáhá vědcům nejen anotovat neznámé části člověka proteomu , ale zejména jim umožňuje porozumět narození, růstu a léčbě rakoviny.

Projekt Human Proteome Folding - Fáze 2 pokračuje tam, kde první fáze skončila. Dvěma hlavními cíli tohoto projektu je získání struktur větším rozlišení určitých lidských proteinů a některých patogenních proteinů, a dále prozkoumat hranice predikci proteinových struktur pokračováním rozvíjet predikce struktur s tímto softwarem. Rosetta . Projekt tak bude reagovat na dva velmi důležité paralelní imperativy, jeden biologický a druhý biofyzikální.

Posláním projektu Společně objevujeme drogu dengue - fáze 2 je identifikovat slibné kandidáty na drogy v boji proti dengue , hepatitidě C , západním Nilu , žluté zimnici a dalším souvisejícím virům. Virtuální screeningové výpočty by měly být prováděny na strukturách nezbytných k identifikaci těchto kandidátů na léky. Fáze 2 projektu je navržena tak, aby snížila počet falešně pozitivních předpovědí (tedy slepých uliček) fáze 1. Fáze 2 bude trvat několik slibných výskytů fáze 1 a každý z nich provede pomocí simulací molekulární dynamiky. aby bylo možné přesně vypočítat Gibbsovu vázanou volnou energii . Tyto výpočty umožní předpovědět těsnost vazby mezi molekulami léčiva a proteázami různých flavivirů . Fáze 2 proto poskytne seznam výskytů mnohem bohatších na skutečné pozitivy.

Cílem projektu Výzkum léčiva pro leishmaniózu je identifikovat potenciální molekuly, které by mohly být vyvinuty jako léčba leishmaniózy. Budou provedeny počítačové simulace ke studiu interakcí mezi miliony chemických sloučenin a určitých cílových proteinů. To pomůže najít nejslibnější sloučeniny, které mohou vést k účinné léčbě této nemoci.

Posláním projektu Dopředu proti malárii je najít slibné kandidáty na léky, které by mohly být vyvinuty jako nové léky, které léčí formy malárie rezistentní na léky. Výpočetní síla sítě World Community Grid bude použita k provádění simulací interakcí mezi miliony chemických sloučenin a určitých cílových proteinů, aby bylo možné předpovědět jejich schopnost eliminovat malárii. Nejlepší sloučeniny budou testovány a vyvinuty do možné léčby této nemoci.

Posláním projektu Výpočty pro udržitelnou vodu je studovat účinky lidské činnosti na velkou oblast a získat hlubší pochopení opatření, která by mohla vést k obnově, zdraví a udržitelnosti tohoto důležitého zdroje ve vodě. Výpočetní síla sítě World Community Grid bude použita k provedení miliónů počítačových simulací k lepšímu pochopení účinků, které by vyplynuly z lidské činnosti v zálivu Chesapeake . Vědci doufají, že to, co se z tohoto projektu naučili, mohou uplatnit po celém světě v jiných regionech, které čelí problému udržitelné vody.

Cílem projektu Výpočty pro pitnou vodu je analyzovat do hloubky na molekulární úrovni počátky proudění vody novou třídou filtračních materiálů. Tato analýza si klade za cíl podpořit vývoj levnějších a efektivnějších vodních filtrů.

Nedostatečný přístup k nezávadné pitné vodě je jednou z největších výzev lidstva pro mnoho oblastí rozvojových zemí. Odhaduje se, že 1,2 miliardy lidí nemá přístup k nezávadné pitné vodě a 2,6 miliardy lidí má malou nebo žádnou hygienu.

Cílem projektu Boj proti rakovině u dětí je objevit léky schopné deaktivovat tři proteiny spojené s neuroblastomem , jedním z nejčastějších solidních nádorů u dětí. Identifikace těchto léků by mohla zlepšit léčbu onemocnění kombinací s chemoterapií .

Posláním projektu Řekni Ne Schistosomu je identifikovat potenciální léky, které by mohly být vyvinuty v boji proti schistosomům . Velká výpočetní kapacita World Community Grid bude použita ke spuštění simulací ke studiu interakcí mezi miliony chemických sloučenin a určitých cílových proteinů. To pomůže najít nejslibnější složku, která může účinně bojovat proti této nemoci.

souhrn

Poznámky a odkazy

1. „  http://www-03.ibm.com/industries/healthcare/us/detail/news/Y344005K66783Y35.html  “ ( Archiv • Wikiwix • Archive.is • Google • Co dělat? ) (Přístup 25 Března 2013 ) .
2. „  Globální statistiky  “ , na World Community Grid ,13. března 2017.
3. „  O nás  “ na adrese worldcommunitygrid.org (přístup 14. října 2020 ) .
4. IBM staví síť pro výzkum neštovic .
5. (en) „  Počítače se zapojily do boje proti bioterorům  “ , BBC,5. února 2003(zpřístupněno 24. listopadu 2008 ) .
6. (in) Clery, Daniel, „  IBM nabízí bezplatné řešení pro humanitární výzkumné projekty  “ ( DOI 10.1126 / science.308.5723.773a , přístup 24. listopadu 2008 ) .  
7. (in) knreed, „  Linux je tady !!!  " , World Community Grid, 31. října 2005(zpřístupněno 30. července 2007 ) .
8. (in) „  Systémové požadavky  “ , Nápověda , World Community Grid (přístup k 28. červenci 2007 ) .
9. (in) Todd Weiss , „  World Community Grid“ se snaží využít nepoužívané počítače  “ , Computerworld , 17. listopadu 2004( číst online , konzultováno 10. listopadu 2010 ).
10. (in) „  ve vztahu k zásadám členů World Community Grid  “ , Soukromí a bezpečnost , World Community Grid (přístup k 10. listopadu 2010 ) .
11. (en) „  Kdo jsme?“  » , World Community Grid (přístup 10. listopadu 2010 ) .
12. (in) „  Vrácení výsledků: Co je pracovní jednotka?  » , Nápověda , World Community Grid (přístup 10. listopadu 2010 ) .
13. (in) „  Instalace agenta Windows: Pokud znovu nainstaluji software, bude navždy ztracena práce, kterou dělám?  ” , Help , World Community Grid (zpřístupněno 5. srpna 2007 ) .
14. (v) „  The Grid  “ , TryScience (přístup k 28. červenci 2007 ) .
15. (in) „  Body: Co je to validace?  » , Help , World Community Grid (přístup k 28. červenci 2007 ) .
16. (in) „  Začínáme: Používám agenta BOINC, jak si mohu vybrat pro svůj počítač procesy práce s projektem qui?  » , Help , World Community Grid (přístup 10. listopadu 2010 ) .
17. (in) bbover3, „  BOINC Migration Announcement  “ , World Community Grid,17. srpna 2007(zpřístupněno 10. listopadu 2010 ) .
18. (in) „  Využití CPU: Proč můj počítač vykazuje vysoké využití CPU?  » , Nápověda , Světová komunitní mřížka (zpřístupněno 14. listopadu 2010 ) .
19. TThrottle .
20. (in) „  Body: Co jsou body?  » , Help , World Community Grid (přístupné 17. listopadu 2010 ) .
21. (in) „  Body: Jak se počítají problémy pro agenta BOINC?  » , Help , World Community Grid (přístupné 17. listopadu 2010 ) .
22. (in) knreed, „  BOINC Points  “ , World Community Grid,2. listopadu 2006(zpřístupněno 17. listopadu 2010 ) .
23. (in) „  Teams  “ , Help , World Community Grid (přístupné 17. listopadu 2010 ) .
24. (in) „  About Us - Our partners  ' , World Community Grid (zpřístupněno 27. listopadu 2010 ) .
25. (in + en) „  News & Updates  “ , World Community Grid (přístup k 27. listopadu 2010 ) .
26. (en + fr) „  Informace a tisková reklama č. 1  “ , News & Media , World Community Grid (přístup 27. listopadu 2010 ) .
27. (en + fr) „  Informations et presse Ad # 2  “ , News & Media , World Community Grid (přístup 27. listopadu 2010 ) .
28. (in) „  Již brzy: OpenPandemics  “ na www.worldcommunitygrid.org ,1 st 04. 2020(zpřístupněno 5. listopadu 2020 )
29. (in) „  Help Stop Covid-19 and Future Pandemics in their Tracks  “ na www.worldcommunitygrid.org ,14. května 2020(zpřístupněno 5. listopadu 2020 )
30. (in) „  Bedam used for the study of protein-ligand affinity  “ , Journal of Chemical Theory and Computation (přístup k 5. březnu 2016 ) .
31. (in) „  FightAIDS @ Home - Phase 2  “ , Scripps Research Institute (přístup ke dni 5. března 2016 ) .
32. (in) „  FightAIDS @ Home - Fáze 2 WCG  “ , World Community Grid (přístup ke dni 5. března 2016 ) .
33. (in) „  Společně přelstít ebola  “ , Výzkumný ústav Scripps (přístup dne 5. března 2016 ) .
34. (in) „  Přelstít ebola společně na WCG  “ , World Community Grid (přístup ke dni 5. března 2016 ) .
35. (in) "  The Clean Energy Project  " , The Clean Energy Project (přístupné 27.listopadu 2010 ) .
36. (in) „  The Clean Energy Project - Phase 2  “ , World Community Grid (zpřístupněno 27. listopadu 2010 ) .
37. (in) „  Mapping Cancer Markers  “ , University of Toronto (přístup ke dni 5. března 2016 ) .
38. (in) „  Mapping Cancer Markers on WCG  “ , World Community Grid (přístup ke dni 5. března 2016 ) .
39. (in) „  Uncovering Mysteries Genome  “ , Fiocruz & UNSW (přístup ke dni 5. března 2016 ) .
40. (in) „  Uncovering Mysteries on WCG Genome  “ , World Community Grid (přístup ke dni 5. března 2016 ) .
41. (in) „  FightAIDS @ Home  “ , Olsonova laboratoř (přístup k 28. listopadu 2010 ) .
42. (in) „  FightAIDS @ Home  “ , World Community Grid (přístup k 28. listopadu 2010 ) .
43. „  http://www.csag.uct.ac.za/worldcommunitygrid  “ ( Archiv • Wikiwix • Archive.is • Google • Co dělat? ) (Přístup 25. března 2013 ) .
44. (in) „  AfricanClimate @ Home  “ , World Community Grid (přístup ke dni 4. prosince 2010 ) .
45. (in) „  The Clean Energy Project - Phase 1  “ , World Community Grid (přístup k 28. listopadu 2010 ) .
46. (in) „  Objevování drog dengue společně  “ , UTMB (přístup k 28. listopadu 2010 ) .
47. (in) „  Objevování drog dengue - společně - 1. fáze  “ , World Community Grid (přístup k 28. listopadu 2010 ) .
48. (in) „  Protein World Database  “ , Ministério da Saúde (zpřístupněno 8. srpna 2013 ) .
49. (in) „  The Genome Comparison Project, Project Progress  “ , Ministério da Saúde (zpřístupněno 8. srpna 2013 ) .
50. (in) „  Přehled srovnání genomu  “ , World Community Grid (přístup ke dni 4. prosince 2010 ) .
51. (in) "  Help Cure svalová dystrofie  " , analytické genomiky (přístupné 27.listopadu 2010 ) .
52. (in) „  Help Cure Muscular Dystrophy  “ , World Community Grid (přístup ke dni 4. prosince 2010 ) .
53. (in) „  Help Cure Muscular Dystrophy - Phase 2  “ , World Community Grid (přístup k 27. listopadu 2010 ) .
54. (in) „  Help Defeat Cancer Project  “ , D r  David Foran (přístup ke dni 4. prosince 2010 ) .
55. (in) „  Help Defeat Cancer  “ , World Community Grid (přístup ke dni 4. prosince 2010 ) .
56. (in) „  Human Proteome Folding  “ , World Community Grid (přístup ke dni 4. prosince 2010 ) .
57. (in) „  Influenza Antiviral Drug Search  “ , World Community Grid (přístup k 28. listopadu 2010 ) .
58. (in) „  Projekt Nutriční rýže pro svět  “ , University of Washington (přístup ke dni 4. prosince 2010 ) .
59. (in) „  Nutriční rýže pro svět  “ , World Community Grid (přístup ke dni 4. prosince 2010 ) .
60. (in) „  help dobýt rakovinu  “ , University Health Network Ontario Cancer Institute, University of Washington Center for High Throughput Structural Biology (přístup k 28. listopadu 2010 ) .
61. (in) „  help dobýt rakovinu  “ , World Community Grid (přístup k 28. listopadu 2010 ) .
62. (in) „  The Human Proteome Folding Project  “ , Bonneau Laboratory (přístup k 28. listopadu 2010 ) .
63. (in) „  Human Proteome Folding - Phase 2  “ , World Community Grid (přístup k 28. listopadu 2010 ) .
64. (in) „  Objevování drog dengue - společně - 2. fáze  “ , World Community Grid (přístup k 28. listopadu 2010 ) .
65. (en) http://www.worldcommunitygrid.org/research/dsfl/overview.do .
66. (en) http://www.worldcommunitygrid.org/research/gfam/overview.do .
67. (in) „  Computing for Sustainable Water  “ , University of Virginia (přístup k 8. srpnu 2013 ) .
68. (in) „  Computing for Sustainable Water  “ , World Community Grid (přístup k 8. srpnu 2013 ) .
69. (in) „  The Computing for Clean Water Project (C4CW)  “ , Centrum pro nano a mikro mechaniku (přístup k 8. srpnu 2013 ) .
70. (in) „  Computing for Clean Water  “ , World Community Grid (přístup k 27. listopadu 2010 ) .
71. (En + ja) „  Help Fight Childhood Cancer  “ , Chiba University a Chiba Cancer Center (přístup 28. listopadu 2010 ) .
72. (in) „  Help Fight Childhood Cancer  “ , World Community Grid (přístup k 28. listopadu 2010 ) .
73. (in) „  Řekněte Schistosoma na WCG  “ , World Community Grid (přístup k 8. srpnu 2013 ) .
74. (in) „  Řekněte Schistosomu ne  “ , Mestrado Tecnologia Aplicada má výpočetní Biologia (přístup k 8. srpnu 2013 ) .
75. „ Time by Project  “ , World Community Grid (přístup k 8. lednu 2014 ) .
76. (en) „  Hypotetická data ukončení projektů  “ , ?? (zpřístupněno 8. ledna 2014 ) .
77. (in) „  End of FightAIDS @ Home - Phase 1  “ , World Community Grid (přístup ke dni 5. března 2016 ) .
78. (in) Konec projektu Computing for Sustainable Water , worldcommunitygrid.org, publikováno 26. září 2012.
79. Konec pomoci vyléčit svalovou dystrofii - projekt fáze 2 , worldcommunitygrid.org, zveřejněno 6. května 2013.
80. (in) Discovering Dengue Drugs - Together Project update March 2013 , worldcommunitygrid.org, Publikováno 22. března 2013.
81. (in) Konec projektu pomůže dobýt rakovinu , worldcommunitygrid.org, publikováno 29. května 2013.
82. (in) Konec projektu GO Fight Against Malaria , worldcommunitygrid.org, publikováno 25. června 2013.
83. (en) (es) Status DSFL Completed , PECET, Universidad de Antioquia, publikováno 5. srpna 2013.
84. (in) End of the Human Proteome Folding - Phase 2 project , worldcommunitygrid.org, publikováno 25. června 2013.
85. (in) „  Computing for Clean Water project update  “ na worldcommunitygrid.org (přístup 14. října 2020 ) .

• (fr) Tento článek je částečně nebo zcela převzat z anglického článku Wikipedie s názvem „  World Community Grid  “ ( viz seznam autorů ) .

Podívejte se také

Související články

• Distribuované výpočty
• Distribuovaná architektura
• BOINC

externí odkazy

• (en) Oficiální stránky o World Community Grid
• (en) Oficiální webové stránky BOINC